科研选题有不同的类型，各类型选题的研究目的、设计要求及研究方法有很大差别，资助经费的方式及强度也有所不同，研究者应当了解它们的特点，并结合研究方向及自身条件来决定选题类型。
1、基础研究。以增加科学技术知识，解决未知领域的理论问题为目的，探索在中医针灸领域中，带有全局性的一般规律的科学研究。如中医针灸学中的经络现象、经络实质、腧穴功能与结构、经脉腧穴与脏腑相关、针灸作用的规律和原理、时效和量效等研究。这类研究特点一般不以具体应用为目的，探索性强，自由度大，风险高。由于未知因素多，在课题设计上要求比较原则，对研究手段要求高。这方面的研究成果常常对整个中医针灸领域甚至可能对生命科学产生深刻的影响。
2、应用研究。以应用为目的，针对中医针灸实践中的某一具体问题进行研究并提出解决问题的方案、方法。如针灸防治临床各科疾病的临床方案、疗效评估体系的研究。这类研究特点是采用基础研究提供的理论和成果，解决具体的问题，因此实用性强，理论和方法比较成熟，风险较小，在课题设计上要求技术路线清晰，方法具体可行，成果具有推广价值。
3、开发研究。以物化研究为目的，运用基础和应用研究的成果，研制出产品，或对产品进行技术工艺改进的创造性研究。如中医针灸诊疗仪器研制或改造等。这类研究是采用较成熟的理论和技术进行产品研究，未知因素较少，风险低，成功率高，具有投资大，经济效益高的特点。这类研究多与企业合作进行，也是今后鼓励的方向。
以上三类研究选题虽然不同，但在科研实践中却有密切联系，基础研究为应用和开发研究提供理论支撑，而应用研究为基础研究提供素材和思路，开发研究又是应用研究的拓展和延伸，同时又为基础和应用研究提供了资金。前二类研究以社会效益为主，而开发研究则以经济效益为先。而不论是哪个类型的选题，我们在选题的时候都需要秉持以下的原则：
需求性。中医针灸学选题必须从国家经济建设和社会发展的需求出发，面向临床、面向生产、面向现代化，要贯彻“统贯全局，突出重点，有所为，有所不为”的原则，分析研究21世纪中医面临的任务和挑战，针对当前及今后一段时间内中医对社会、经济和卫生事业发展有重大影响的关键问题开展重点研究。
创新性。创新是科研的灵魂，也是科研选题应当遵循的一条基本原则，具有创新的研究课题，是前人没有认识以及没有完全解决的问题，因而具有先进性和新颖性。中医针灸基础研究的选题要以丰富和发展中医针灸学基础理论作为重点，通过研究，有获得新见解、新发现的可能性。
3、科学性。选题的科学性，首先体现在科研选题来源于临床实践，有客观事实或合乎逻辑推理的科学理论根据，不是主观臆想或凭空猜想。同时，在实验设计上：选题具体而明确，试验设计类型选择正确，统计学设计合理，专业设计的研究因素、研究对象及观察指标选择合乎研究目的的要求，设计规范严谨，技术路线清晰，方案具体可行，试验步骤合理，实验方法先进。
4、可行性。是指选题实施的可能性，即是否具备实施的条件。包括申请者是否具备开展本项研究的工作经验和研究能力，是否具备相关的前期工作基础，申请单位是否具备相关的基本工作条件，课题组成员年龄层次，知识结构是否恰当，所需资金预算是否合理等。选题要从实际出发，量力而行，实事求是。