有影响。
1、换发动机对车造成车辆贬值。
2、换发动机可能对汽车动力和油耗有影响。
3、拆装发动机时对汽车线路及其它部件都有影响。
4、更换新的发动机总成后需要到车管所进行登记注册，更换新的发动机号码。5、换发动机维修费用高昂等。
更换发动机总成对车辆的影响：
1、车辆管理的麻烦
更换新的发动机总成时，要购买到相同排量的同型号的发动机总成，发动机在出厂的时会有发动机编号，更换新的发动机总成后需要到车管所进行登记注册，更换新的发动机号码。
如果不及时到车管所登记，会导致车辆年审不过、无法过户等等问题。
2、装配工艺的不确定性
车辆使用中途更换发动机总成一般在修理厂或者4S店由维修技师进行操作，换的发动机不是原装发动机，是收回旧发动机缸体另行组装的，并且在细节的处理上肯定不如原厂装配的工艺，拆装发动机对线路及其它部件都有影响，后期使用上存在很多不确定的因素。
3、造成车辆贬值
二手车原装的车残值率的高低决定了车辆的价值，懂车的人在购买二手车的时会检查是否更换过发动机，一但发现更换过发动机总成，那么车辆的保值率会大大降低。
4、对汽车动力和油耗的影响
旧的发动机内部会存在或多或少的积碳，更换新的发动机会降低些油耗和提升些动力，但车辆使用一段时间产生积碳后油耗和动力也会相应的上升和降低。
新车更换发动机对整车有影响吗
对整车没有影响。对动力性能的提升最有效的方式就是更换发动机，首先是电脑的改装。由于现行的车辆愈来愈精密，因此诸如转速限制、时速限制、点火正时、空燃比调整等都交由行车电脑去执行，通常所说的改装电脑只是将控制晶片加以更换，借由不同的设定使车辆的性能有所提升。改电脑可将原厂所限定的转速与时速加以解除，但使用时要多加注意。发动机长期处于高转速的状态，对于内部机件损耗有相当严重的影响，若是将转速限制解除，在享受高转速带来的快感背后，就是加速降低引擎的使用寿命。至于解除原厂对于安全极速的限制，从安全角度看，我们不太赞同。因为每部车出厂时，原厂会根据车辆本身的性能与结构，在极速上有一定的限制，安全第一是此举的主要考量。