构建进化树有哪些方法?
构建进化树有哪些方法?
构建进化树的方法包括两种:一类是序列类似性比较,主要是基于氨基酸相对突变率矩阵(常用PAM250)计算不同序列差异性积分作为它们的差异性量度(序列进化树);另一类在难以通过序列比较构建序列进化树的情况下,通过蛋白质结构比较包括刚体结构叠合和多结构特征比较等方法建立结构进化树
答:进化树刚体结构叠合比较当已知2个以上同源蛋白质的晶体结构时,可将每两套结构的原子坐标进行最佳叠合,确定类似结构中完整的一套残基等价位点,并使等价位点间的距离平方...详情>>