马来西亚地势北高南低，除沿海为平原外，全境大部分为山地，八条大体平行的山脉纵贯，大汉山海拔2190米，为西马来西亚最高峰。以吉保山脉为分水岭，西侧霹雳河最长，东侧彭亨河最长。
东马来西亚则沙捞越及沙巴两洲组成，位于印度尼西亚的加里曼丹岛北部。沙捞越地区北部沿海为冲积平原，内地为森林覆盖的丘陵和山地，山峰多在海拔200米左右。沙巴洲地区西部为平原，内地多森林覆盖的山地，克罗河山脉纵贯南北，主峰基纳巴卢山（又名神山）海拔4101米，是最高峰。
东西马来西亚两部分最近处距离600公里，均位于北纬1度至7度。靠近赤道地带。海岸线长约4190公里，其中西马来西亚2000公里，东马来西亚2190公里（沙捞越740公里，沙巴1450公里）。
马来群岛的地形特征是什么
马来群岛上的地形以山地为主，且多分布在岛屿中部。平原比较狭小，主要分布在沿海，只有爪哇岛北部和苏门答腊岛东部平原面积较大。
马来群岛处于地壳运动活跃的地方，由于三大板块（太平洋板块、印度洋板块和亚欧板块）彼此挤压，时常引发地震。在地壳隆起形成山地的同时，地下灼热的岩浆也顺地裂缝上涌，在地面喷发形成火山。印尼和菲律宾是东南亚火山数量最多的国家，印度尼西亚有400余座火山，其中的120座为活火山菲律宾也有52座火山。
这些火山主要分布在印尼的苏门答腊岛、爪哇岛、努沙登加拉群岛和菲律宾的一些岛屿上。这些岛屿呈弧形自东向西延伸，因而人们形象地称之为“灯火走廊”，这里是世界上地震和火山爆发最多的地区，是东南亚“最不安定”的区域。
马来群岛的气候分属于两种类型。印度尼西亚群岛主要是赤道多雨气候，全年高温多雨，是典型的赤道气候。但由于受位置（分居南北半球）和地形等因素的影响，内部气候仍有差异。
另一方面，印度尼西亚群岛的气候介于亚、澳两大陆气候之间，亦兼有热带季风气候的特色，这是印度尼西亚群岛气候与非洲和南美大陆赤道多雨气候的不同之处。菲律宾群岛属于典型的海洋性热带季风气候，全年炎热、湿润，年分二季，随着季风方向的更换，雨量的季节分配和空间分布发生变化，此外，强大台风的频繁出现是菲律宾群岛气候的重要特征之一。