新农合参合人患大病发生高额医疗费用时,按现行新农合政策补偿后,需个人负担的合规医疗费用超过起付线部分,再由大病保险给予保障和进行二次补偿。补偿的起付线,参照当地统计部门公布的上一年度农村居民年人均纯收入确定,对符合医疗救助条件的参合人,起付线下降50%,起付线每参合年度内只扣减一次。 新农合大病保险的分段补偿线,参合患者进行第一次补偿后,再把个人年度累计负担的合规医疗费用减去起付线金额,0元至5万元部分,补偿比例为50%；5万元以上至10万元部分,补偿比例为60%；10万元以上部分,补偿比例为70%。大病保险年封顶线为25万元。
