游离的意思就是没有成键的。比如游离氨基就是-NH2，游离羧基就是-COOH。所以蛋白质主链上，只有末端有一个游离的氨基，一个游离的羧基。中间的氨基和羧基都以形成肽键-CO-NH-，不称为“游离”。注意，虽然“主链”上只有一个游离的氨基，一个游离的羧基。但侧链（即R基）上仍有可能存在这两个基团。要看氨基酸具体是什么，才能计算还有多少游离的氨基和羧基。比如，赖氨酸的R基上有一个游离的氨基，谷氨酸的R基上有一个游离的羧基，等等。另，有人说没有形成肽键的都成为“游离的”，是不对的。无论形成什么键，只要成键了就不是游离的了。比如，氨基酸的羧基其实是可以酯化的，形成-CO-O-R'型的酯，此时不是肽键，但也绝不是“游离的”。
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