长根菇菌种分离与培养如下：(1) 母种分离菌种分离宜采用组织分离法。每年7-10月份是野生长根菇发生的季节。因出土后的子实体常被 菇蝇蛀食，菌柄和菌褶中常有小蛆，故利用开伞后的子实体作 分离材料，很容易造成污染，分离成功率低。因此，最好选择幼蕾供分离之用。
  在进行分离之前，要注意检査菇蕾上是否 有被蛀的虫孔，若有虫孔则不宜作分离材料。对分离材料表面灭菌处理，然后从菌盖中取一小块组织 或一小片菌裙，用无菌接种针接种到PDA斜面培养基的中 央，在24C-28°C条件下培养，经6-8天，菌丝在培养基斜面长满。
  再经转管纯化培养，即可获得纯母种。长根菇菌丝 体白色，气生菌丝旺盛，绒毛状，培养基不变色，菌丝层后期边缘带褐色。（2)母种培养基配制母种采用以下培养基配方。配方1:胡萝卜100克，葡萄糖20克，琼脂20克，水1000- 300 毫升。配方2:马铃薯200克，蔗糖20克，磷酸二氢钾3克，硫 酸镁15克，琼脂20克，水1000毫升。
  配方3:酵母膏20克，蔗糖20克，磷酸二氢钾1克，磷酸 氢二钾0。5克，硫酸镁0。5克，琼脂20克，水1000毫升。配方4:杂木屑200克，麦麸20克，蔗糖20克，琼脂20 克，水1000毫升。配方5:马铃薯200克，麦麸50克，葡萄糖18克,磷酸二氢钾2。
   5克，硫酸镁1。 5克，维生素氏10毫克，琼脂20克，水 1000毫升。上述培养基按常规方法制备、灭菌，接种后，在25°C- 26°C条件下培养6-7天，菌丝较为洁白长满料面培养基。(3) 原种和栽培种制作培养基配方常用以下几种。配方1:小麦94%(浸泡过夜，翌日煮沸15分钟），杂木屑 5%，石裔1%，料与水比1 : 1。
  2-1。3（以下同）。配方2:棉籽壳78%，麦麸20%，蔗糖1%，石青1%。配方3:杂木屑78%，麦麸20%,蔗糖1%，石裔1%。按常规装瓶、灭菌、接种，置于25度士It培养。750克瓶 装原种35-40天长满；15厘米X26厘米袋装栽培种35天左 右长满。
  在杂木屑、麦麸培养基生长的菌丝洁白，绒毛状，气 生菌丝较为发达。