甲类的otc标识为红色标记，乙类的otc标识为绿色标识，甲类乙类药品都是医保范围内的。 非处方药管理办法中甲类必须在药店销售，乙类除可在药店销售外，还可在普通商业企业等地方销售，但必须经过当地地市级以上药品监督管理部门审查、批准、登记，符合条件的颁发乙类非处方药准销标志。
而医保目录是根据国家基本药物目录筛选的,甲乙类是按照疗效价格比确定的,也就是说疗效确切且费用低廉的均被列入甲类,不需自付。而乙类基本有自付比例,具体由各地方定;还有各地劳动和社会保障局对医保乙类品种有调整权利,调入和调出总量控制在品种数量的15%以内,而各地均无权对医保甲类品种做调整。
门诊使用时，都可以用卡上的医保个人账户支付。 住院使用时，乙类药品与其他乙类费用，参保人结算时，乙类先自负10%后，和甲类费用一起算基本医疗费用，超过医院门槛费的部分一起享受统筹支付比例（城镇职工医疗保险百分之八十几，城镇居民医疗保险百分之四五十）。
简单地说，乙类费用在住院时，自己出钱多一些。医保住院报销——自费除开，乙类费用先自付10%后，超过门槛费的部分，就可以“报销”百分之八十几了（职保）。不是你垫付现金以后凭票据报销，而是在医疗保险定点医院住院时，出具医保卡，让统一的医保结算系统读取参保人资料，办理住院号，在出院结算时，医保系统就不收取你“该报销的”部分——统筹支付部分。
人力资源和社会保障部2009年11月30日正式发布2009版《国家基本医疗保险、工伤保险和生育保险药品目录》，将 《国家基本药物目录》中的治疗性药品全部纳入《药品目录》甲类部分。 《国家基本医疗保险、工伤保险和生育保险药品目录》是基本医疗、工伤和生育保险管理的一项重要标准，原劳动保障部先后在2000年和2004年发布了两版药品目录，两版药品目录在全国各地得到了普遍执行，保障了参保人员的基本用药需求。
扩大用药范围提高用药水平 《药品目录》分西药、中成药和中药饮片3部分。其中，西药部分和中成药部分用准入法，规定基金准予支付费用的药品，基本医疗保险支付时区分甲、乙类，工伤保险和生育保险支付时不分甲、乙类；中药饮片部分用排除法，规定基金不予支付费用的药品。
按照规定，统筹地区对于甲类药品，各地需按照基本医疗保险的规定全额给付，不得再另行设定个人自付比例。对于乙类药品各地可根据基金承受能力，先设定一定的个人自付比例，再按基本医疗保险的规定给付。 据介绍，这次药品目录调整主要针对西药和中成药，2009年版《药品目录》在保持参保人员用药政策相对稳定连续的基础上，根据临床医药科技进步和参保人员用药需求变化，适当扩大了用药范围和提高了用药水平。
新版《药品目录》的西药和中成药共有2151个，西药部分共有药品1164个，其中甲类349个，乙类791个，另有20个仅限工伤保险用药，4个仅限生育保险用药。中成药部分共有药品987个，其中甲类154个，乙类833个。 与2004年版《药品目录》相比，新版《药品目录》主要有以下几个方面的变化：
一是把《国家基本药物目录》的药品，全都纳入《药品目录》的甲类部分，按照基本医疗保险相关规定，甲类目录的药品参保人员不设个人自付比例且各地不得进行调整，因此，可以保证国家基本药物的报销比例高于非基本药物，要求各地在12月要开始执行甲类目录。
考虑到各地用药习惯的不同，地方对乙类目录可以在15%的范围内进行调整，并在明年3月底前完成调整工作，尽快执行新的药品目录。
二是适当增加了新药品种，与2004年版药品目录相比，新版药品目录共增加了260个药品，增幅13。7%，增加的药品都是近几年上市的经临床验证疗效确切、安全性高的新药。
三是对原目录中部分可以被更好的药物替代或无人使用的药品调出，使药品目录的结构更趋合理。
四是加强对医疗机构用药的管理，对于同类药品要求不能叠加使用，以防药品滥用，对部分易滥用的药品在支付范围上进行了限定，一方面保证参保患者的治疗需要，另一方面也避免药品滥用，控制药品费用不合理支出。
五是对目录外的临床紧急抢救和特殊疾病治疗必需的药品，要求各地要建立定点医疗机构申报制度并明确相应的审核管理办法，对部分临床疗效确切，有重大创新价值、但价格昂贵可能对基金产生风险的药品，另行制订谈判准入的办法。
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