医保的部分是要从工伤赔偿中扣除的。 各种因公保险的目的是保障你的医疗（也就是你的身体健康，不因为工作的原因遭到伤害或者遭受了伤害以后，能够得到及时的治疗），不是让你以此来赚钱的，所以无论是谁都是这样 工伤后治疗时用个人医保的，在计算工伤赔偿时，要把这一部分费用扣除，如果工伤后先自费（或单位垫付）医疗费的，在被认定工伤后，这部分费用就给予报销。
但是有一点你你必须了解，是不是工伤是需要认定的（如果企业没有买工伤保险的话，这部分费用（工伤治疗和补、赔偿费）就由单位出，工伤认定以后不能报销的那一部分也有用工单位出） 所以以后如果有工伤，应当让企业垫付先期的治疗费用，因为你个人名下的医疗保险是可以带走的（医疗保险保障的是你的疾病治疗，而不是工伤，如果你用医保看工伤，那么医保也是算成疾病的），如果有剩余的部分也是可以继承的。
简单点，医保是你个人的，无论什么伤、病都可以治疗（无论你是否有病都享有并积累余额）； 工伤是属于由工伤保险和企业承担的，他专门真的的是因公受伤的情况，你不受伤干一辈子和你也没有关系，如果受了工伤，哪怕只干了一天，也得给你治疗，补、赔偿。
