解剖检查是对患病临死或死亡后的竹鼠进行解剖，观察胸腹内各器官病理变化及受损情况，以能全面准确地诊断，采取有效的针对性防治措施，防止疫病的暴发和蔓延，也有助于以后竹鼠出现同样病症时能快捷、准确地诊断。竹鼠解剖检查包括了解一般状况、外部检查和内脏检查三大部分。
  （1）了解死前情况解剖前首先要对竹鼠的性别、饲养管理、投喂的伺料、清洁防疫、发病和病死时间、用过何种药物、发病时鼠有什么表现等情况要了解清楚，以便更准确地对症用药。（2）外部检查对将要进行解剖的病或死竹鼠在解剖前应先对整个竹鼠外表进行检查，若是死体，则要观察尸体有无腐败现象，若腐败较严重的则不宜进行解剖检查，即使解剖检查效果也不准确，若无腐败现象则应对可视黏膜、五官、肛门、外形、皮肤等部位进行检查。
  看口腔是否肿胀或充血或有脓；鼻腔有无分泌物或其他症状；两眼有无分泌物，可视黏膜有无充血、出血，或分泌物的颜色变化等；被毛是否脱落、蓬乱污染、湿；肚子有无肿胀、鼓硬或软或有积液；肛门周围有无粪便或尿液残留；皮肤有无外伤等。（3）内脏检查先将竹鼠仰躺，用手术刀或是刀片按肚皮中间线将竹鼠肚皮划开一点，然后用手轻提划破口，+再用手术剪刀将整个肚皮、胸肋骨剪开，若腹腔中有积水，则将积水吸掉或是倒出，然后对胸腔内脏和腹膜进行f检查，看颜色、病变及症状等。
  首先对肺进行查看，看肺表面颜色有无变化，有无血点、白膜包裹、痰、肿大、肿块或疱疹等，若肺有痰或血、点、血膜，则为病毒感染；再查看肝、肾、脾脏，看有无7肿大、颜色变化，是否有分布不均的血点、白块、坏死，或肿瘤结节等；胃有无胀肿或胃壁有无肿结块等，若胃肿胀而其他器官无变化，则为消化不良；再检查小肠和直肠有无胀气、红肿块、结节，将肠剪开看有无溃疡或肠壁增厚等情况；检查睾丸及卵巢发育情况或病变，看是否有出血、肿块、大小及颜色和形态，看有无萎缩、坏死肿胀等。
  最后查看喉、气管、食道等。检查后将所有的部位症状进行登记整理、分类，以总结患病竹鼠临床诊断的原始资料及以后对病鼠病情的判断。