秘鲁利马的国立农业大学（Universidad Nacional Agraria)已 经开始收集各种栽培的玛咖及其独行菜属的野生种，他们四次前往 玛咖的主要产地，采集到93个玛咖新增种和41种野生玛咖。大多 数玛咖来自于Pasco、Junin湖的东岸、Mantaro山脉高处，其分 类主要以玛咖的各种形态学特征不同，主要是胚轴的形状和颜色 而这些不同形状和颜色的玛咖基本分布在同一 个地理分布区内，是一个种内的细小差异，例如，根外皮的颜色， 主根分支差异，叶片羽状深裂的程度等。
目前来看，这些形状能够 稳定遗传的不多，很多与气候、种植条件有关，部分特性如黑色外 皮玛咖、紫色外皮玛咖也能稳定遗传，但总体来看，根据形状和外 皮分出的不同玛咖应该属于玛咖种（species)的变形（forma)。这 些不同类型的玛咖在国立农业大学被长期妥善保藏。
后来经过重新 确认，大多数品种是相似的，最终他们采集的玛咖被定位为33个 新增种，收藏在利马的国际马铃馨研究中心（International Potato Center)。最终结果也可通过查询网上国际农业咨询组织 (CGIAR)的 SINGER (System-wide Information Network on Ge- netic Resources)站点获得。
分子标记（molecular markers)是以个体间遗传物质内核昔酸 序列变异为基础的遗传标记，是DNA水平遗传多态性的直接的反 映，与其他几种形态学标记相比，DNA分子标记具有显著的优越 性，因而随着分子标记技术的日趋成熟，它已被应用于遗传图谱的 构建、遗传多样性分析、目的基因定位、DNA指纹库的建立等许 多研究领域，目前已在玉米、大豆、鸡、猪等动植物育种和生产中 有许多应用，主要集中在基因定位、辅助育种、疾病治疗等，而中 药DNA指纹图谱技术在药材鉴别、GAP实施、道地药材研究、 遗传育种和种质资源研究及中成药质量控制等领域也取得了很多成 果，应用前景广阔。
分子标记技术在玛咖上也将有很大的应用价值，尤其在玛咖 种质的检测、玛咖的分类和分子标记辅助育种方面。以玛咖的分 类来看，传统的玛咖分类方法主要是形态标记分类法，具有很大 的不可靠性，许多玛咖品种分类是否准确仍需进一步研究，例 如，仅仅依靠玛咖根的外皮颜色、种子形态、幼苗形态等来对玛 咖栽培种进行分类的方法是很不可靠的，玛咖根的颜色会受到水 分、栽培地域、阳光、温度等很多因素干扰，从种子形态和幼苗 形态来看差异也很小，分类结果有较大的不可靠性。
2003年， 捷克科学家Lebeda A等通过研究玛咖的同工酶多态性来辅助玛 咖分类，结果也发现，筛选出来的酯酶多态性也不能与作物形态 学分类相对应。而通过玛咖DNA分子标记技术进行玛咖分类是 通过玛咖DNA水平上遗传多态性的差异，其不受环境等诸多因 素影响，可提供稳定的DNA谱带作为分类重要参考，在分类上 可靠性更好。
此外，分子标记技术还有利于构建出玛咖亲缘关系树，为培育 玛咖新品种奠定基础，还可以通过长期的积累，确定玛咖优良的生 产性状，并筛选出生产性状优劣评价的若干分子标记，可准确快速 地确定玛咖良种，2007年Solis J等人就从玛咖中筛选得到可以对 抗致病疫霉扣奶5)的抗性基因Zm-de/，该致 病菌常常侵染西红柿和马铃薯，这项成果一方面可推动新的转基因 研究，也提供了玛咖的一个优良性状分子标记，在玛咖分子标记技 术上也具有一*定意义。
1998年，Toledo J等人用分子标记评价玛咖和其他分布在安 第斯山区的独行菜属植物的遗传变异性，具体为采用RAPD标记 对从厄瓜多尔、秘鲁和玻利维亚采集的29种玛咖栽培种和27种野 生独行菜属植物进行基于相似度的系统发生调查。结果发现，栽培 组的相似度高于0。
952,表明栽培的玛咖多形性比较低，野生独行 菜属植物中也没有发现玛咖的祖先。 本研究所已经在湖北省科技厅大力支持下开展了玛咖分子标记 技术在DNA指纹图谱建立及遗传多样性方面的工作 ， 共收集到18份玛咖材料，与玛咖同属的几种独行菜材料，与玛咖 形似的芜菁、萝卜和芥菜等材料，并已完成相关序列扩增多态性 (sequence related complified polymorphism, SRAP) -PCR 反应体 系的建立及引物筛选，对影响SRAP的关键因素（TaqDNA聚合 酶、Mg2+、dNTPs、引物等）进行了优化，获得扩增条带清晰、 多态性丰富的多个引物组合。
为玛咖种质遗传多样性评价、分子标 记辅助育种和遗传改良研究奠定了基础。 。
答：分子标记 在农业基础与应用研究领域，分子标记技术已开始应用于作物种质资源和育种的研究，特别是在构建分子遗传图谱和标记目的性状基因方面取得了很大的进展。 形态标记...详情>>
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