为防止床土传带病菌，既应注意田块的选择，还应进行床土消毒。床土消毒常用方法有： (1) 用福尔马林（40 % 甲醛）消毒，可消灭猝倒病和菌核病病菌。福尔马林用量：200〜300毫升福尔马林加水25〜30千克，可消毒床土 1 000千克。 (2) 用抗菌剂40 % ，或多菌灵50 % ，或 70%苯来特消毒，每平方米苗床面积，厚 7〜10厘米的床土，用上述药剂4〜5 克，加水溶解后喷洒床土，拌和均匀。
加水量依床土湿润情况而定，以充分发挥药效。苗床要充分通气后才能进行播种或分苗。 (3) 可按每平方米床面用25%多菌灵20克，加 500〜1000克干细土拌匀，撒在床面上，或每立方米老菜园土床土用0。1 %的高锰酸钾液7〜10千克喷洒后，用薄膜盖严，闷3〜4 天，都有一定的杀菌作用。
(4)高温消毒，夏季高温季节，把配好的床土放在密闭的大棚或温室中平摊10厘米厚，使棚室中午的温度达到60°C，这样连续7〜10天，可消灭床土中部分病菌，如猝倒病、立枯病、黄萎病等。
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