一是保护生物和遗传多样性。自然湿地按照着自然演替规律，生态系统构造的复杂性和稳固性较高。生物物种十分丰富。很多的自然湿地不只为水生动物，水生植物供给了优秀的生计场所，也为多种珍稀濒危野生动物，特别是水禽供给了一定的栖息、迁移、越冬和繁殖场所。能够说，没有保存完满的白然湿地，很多野生动物将没法达成其生命周期，湿地生物多样性将失掉安身之地。同时，白然湿地为很多物种保存了基因特征，使得很多野生生物能在不受扰乱的状况下生计和繁衍。所以，湿地当之无愧地被称为“生物商场”和“物种基因库“。湿地保护在生物多样性保护中据有十分重要的地位。
二是减缓径流和蓄洪防早，很多湿地地域是地势低凹地带，与河流相连，所以是天然的调理洪水的理想场所：湿地被围困或淤积后，这些功能会大受损失。在干早季节，湿地可将洪水期间容纳的水量向下游和周边地域排放，防早功能十分显然。
三是固定二氧化碳和调理地区天气。湿地因为其特殊的生态特征，在植物生长，促淤造陆等生态过程中累积了大批的无机碳和有机碳，因为湿地环境中，微生物活动弱，土壤汲取和开释二氧化碳十分迟缓，形成了富含有机质的湿地土壤和泥炭层，起到了固定碳的作用。假如湿地受到损坏，湿地固定碳的功能将大大减弱或消失，湿地将由“碳汇”变为“碳源”，对全世界天气将产生重要影响。
《湿地条约》和《结合国天气变化框架条约》还特别强调了湿地对换节地区天气的重要作用，湿地的水分蒸发和植被叶面的水分蒸腾，使得湿地和大气之间不停进行了能量和物质互换，对周边地域的天气调理拥有显然的作用。
四是降解污染和净化水质。湿地拥有很强的降解污染的功能，根多自然湿地生长的湿地植物、微生物经过物理过滤、生物汲取和化学合成与分解等把人类排入湖泊、河流等湿地的有毒有害物质转变为无毒无害甚至有利的物质，如某些能够致使人类致癌的重金属和化工原料等，能被湿地汲取和转变，使湿地水体获得净化。