组织培养毒素检测是实验室诊断的金标准。如果经培养的单层
细胞暴露于经过滤的粪便上清液后出现卷缩，则提示有毒素B的存 在(细胞病理学效应[CPE])。虽然毒素A是腹泻的主要原因，但毒 素A和毒素B的产生几乎是相关的。这样，毒素B的出现是毒素A 的可靠标志。组织培养毒素检测有技术上的难度，并至少需要2~3 天才能完成。其他问题是，毒素可能被蛋白酶或因冷冻破坏,导致实 验误差。
酶联免疫标记法(elisas)可用于毒素的检测，就像单独检测毒 素A—样，它可以检测所有毒素；所设计的ELISA可以只检测毒素 A和毒素B。其敏感性和特异性一般为85% ~90%，而且具有2~ 3h就出结果的优点。
细菌培养在技术上可能是最困难的；各实验室之间培养的结果
差异很大，而且费时。若无细菌生长，至少需培养3天才能作出培养 阴性的判断。另外,单纯培养并不能提示细菌是产毒株。在某些实 验室中，有25%以上培养出的细菌是非产毒株。这样，在宣布培养
出的细菌为致病菌之前,为了检测细菌的产毒情况尚需做进一步的
试验。
对某些患者可使用内镜进行临床诊断。然而，即使在PMC出 现最严重的、具有特征性的表现时，仍主张同时进行组织学诊断。然 而，不管怎样，对一位PMC患者开始进行治疗常依据于内镜的检查 发现及其活检的结果。当出现结肠炎而没有达到PMC这一程度
时，单独依靠内镜检查进行诊断的难度较大。据报告，10% ~30 %的 PMC患者,其病变在乙状结肠以上部位，故当乙状结肠镜检査阴性 时，仍需进行结肠镜检以证实或排除诊断。乳胶凝集试验可检测谷 胺酰氨酶(一种由各种难辨梭菌产生的酶)。遗憾的是，其他厌氧菌 也可以产生这种酶。因此，该试验的敏感性仅为70% ~80%,特异 性为85% ~95%。该试验不能区别产毒株与非产毒株。
作为辅助诊断，DNA探针和聚合酶链反应（pcrs)仍在研究之 中。
上述试验精确性都不是100%的，必须根据患者的临床表现来 分析试验结果。产毒株完全可以从没有疾病的患者中分离出来。
