湿温的病因，是感受湿热病邪。但湿热病邪能否感人，感染后能否发病，还取决于脾胃阳气的胜衰。如饮食不节，饥饱无度，过食生冷而损伤脾胃，则易内湿停聚。特别是在夏秋之节湿盛之季，脾胃之机多较呆滞，尤易导致湿邪内困，在此情况下，外界湿热之邪便易乘虚而入，薛生白说：“太阴内伤，湿饮停聚，客邪再至，内外相引，故病湿热。”
湿温病的发生，虽邪气侵入的途径不一，但病变部位则在脾胃。起病即有湿邪困脾的气分证，此时虽兼有湿
邪在表的卫分证，但为时较短，随着表征的解除，则主要表现在气分湿热。但同时还必须分清湿邪所在的部位及湿与邪的孰多孰少。
湿重于热：治宜祛湿为主，兼以清热。若湿郁上焦，多见头昏胀痛，胸闷不舒。治宜辛开宣降肺气，药用杏仁、橘红、枇杷叶等，使肺气宣畅，外资卫气之宣发以散表邪，内助水道之通调以利水湿。湿阻中焦者，可见脘痞腹胀，呕恶便溏，口淡不渴等症。治宜芳香化湿或苦温燥湿，药用藿香、佩兰、白蔻、半夏、石菖蒲、厚朴等，振奋胃气，苏醒脾气，使中焦气机宣畅，升降复常，则水湿自化。湿蕴下焦，则小便不利，治宜淡渗之品，药用茯苓、猪苓、泽泻、滑石、通草等。下焦阳气，以利小便。曹炳章说：“湿即气也，气化则湿化……，在上焦则化肺，在中焦则化脾气，在下焦则化膀胱之气”。华云岫讲得更为具体，他在总结叶天士治湿病的经验时说：“今观先生治法，若湿阻上焦者，用开肺气，佐渗湿、通膀胱，是即启上闸，开支河，导水势下行之理也；若脾阳不振，湿滞中焦者，用术朴姜半之属，以湿运之；以苓泽、腹皮、滑石等淡泄之，亦犹低湿处，必多烈日晒之，或以刚燥之土培之，或开渠以泄之耳。”然三焦又为一整体，用药当互为策应。
热重于湿：治宜清热为主，兼以祛湿。此时若仍以祛湿为主，则辛苦香燥之品必使津耗而热增，以致化燥，故清热当为主法。但热中挟湿，与因热致燥者不同。治热而燥者，可用清热滋阴之品；治热而湿者，则宜清热燥湿之品。药用黄芩、黄连、栀子等。
湿热并重：治宜清热利湿并施。此时若“徒清热则湿不退，徒祛湿则热热愈炽”，故应清热与祛湿两法并用。即所谓辛开苦泄法。非辛香不足以宣气化湿，非苦寒不足以燥湿清热，是以黄芩滑石汤、杏仁滑石汤、连朴饮等主之。
湿热化燥：湿热日久，化火化燥，其证治同于温热类温病。如邪热在气分，或清或泻；在营血分，或凉或散。其中热伤肠络而便血，若下血过多，气随血脱者，则宜益气固脱以救急，后再随证施治。
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