北京协和医学院的前身，是协和医学堂。1906年，英国伦敦会联合美国公理会、美以美会、长老会、伦敦教会医学会和英格兰教会五个英美教会团体共同创办了这所近代中国第一个联合教会医学校。所以，“协和”的本意为“联合”或者“团结”之意，译成“协和”很雅致。
“武汉协和”二字则源自汉口本地教会医院。1866年9月，英国基督教伦敦会传教士杨格非创办了汉口伦敦会医院，位于汉口后花楼街伦敦会花楼总堂旁，后取“仁爱济世”之义，定名为汉口仁济医院。1926年，创办汉口仁济医院的英国基督教伦敦会和创办汉口普爱医院第二分院的英国基督教循道会决定将两所医院合并。1928年4月，两院正式合并，定名为汉口协和医院，位于汉口西满路（今解放大道现址）。
协和医院名称来源

北京协和医学院（Peking Union Medical College），位于北京市，是国家卫生健康委员会直属、与中国医学科学院实行院校合一管理体制的全国重点大学，世界一流学科建设高校，入选卓越医生教育培养计划。
学校前身是美英基督教教会于1906年共同创办的协和医学堂。1912年，改称协和医学校。1917年，成立北京协和医学院。1919年，改名北京协和医科大学。1929年，更名私立北平协和医学院。1951年1月，学校由中央人民政府教育部和卫生部接管，且改名为中国协和医学院。历经传承与发展，学校先后更名为中国医科大学、中国首都医科大学和中国协和医科大学。2006年定名北京协和医学院。
协和医院名称来源

“协和”一词最早为union的雅意，最初的意思是西方传教士和慈善机构在中国为了适应清末民初的实际环境创造的一种特殊的医疗模式。
当时的中国在经历了“庚子国难”后，国家权威跌落到了最低点，传教士没有了来自中国官方的阻碍，纷纷离开沿海的口岸，深入到了内陆乡村。
在那里，面对着乡土、宗族等思想十分都严重的乡村社会，传教士能够打开局面的最好武器莫过于现代医学—在治病救人的过程中改变乡村居民对基督教的认识。
在这其中一大批教会医院应运而生，从数据上看，尽管最早的教会医院在中国设立于鸦片战争之前，但是1900年庚子国难后的发展最为迅速，堪称是如雨后春笋一般短短几十年就超过了之前几十年发展的规模。