毕业生推荐表和就业协议书的区别有：
第一，两者的作用不同：
毕业生推荐表的作用：
毕业生推荐表是毕业生具有就业资格的证明文件。只有国家计划内招收的毕业生才有资格领取毕业生推荐表。定向、委培毕业生、非国家计划内招收的毕业生没有推荐表。
毕业生推荐表是毕业生申请户口、报考公务员等的必备资料。用人单位申报解决毕业生户口，推荐表是要提交的申报材料之一。同时，毕业生如果报考国家公务员，也必须要提交推荐表。
毕业生推荐表是学校向用人单位推荐毕业生的正式书面材料。推荐表内容需要经过毕业生所在高校审核并加盖公章。
就业协议书的作用：
就业协议由学校作为见证方，有利于保护毕业生的合法权益。就业协议经学校和地方就业主管部门签署意见后，具有一定的行政约束力，聘用双方不得任意违约。
就业协议是一种文字契约，确定了甲乙双方的聘用关系，毕业生不得另找单位，学校按协议派遣后，用人单位不得拒收毕业生。
就业协议毕业生实现自我保护的基本依据。签订就业协议书是国家为规范高校毕业生就业工作，避免混乱，杜绝就业欺诈行为，维护高校毕业生就业工作严肃性，为维护毕业生、用人单位和学校的合法权益而采取的一项必要措施。
第二，两者的内容不同
毕业生推荐表的内容有：
基本情况、学业情况、本人简历、本人特长、爱好、社会表现及社会活动能力、在校奖惩状况、本人就业意愿、学校推荐意见、备注等信息。
就业协议书的内容有：
高校毕业生基本情况，应包括：姓名、性别、身份证号、专业、学制、毕业时间、学历、联系方式等。
用人单位基本情况，应包括：单位名称、组织机构代码、单位性质、联系人及联系方式、档案接收地等。
高校毕业生和用人单位约定的有关内容，可包括：工作地点及工作岗位户口迁入地违约责任协议自动失效条款、协议终止条款
双方约定的其他事宜。各方应严格履行协议，任何一方若违反协议，应承担违约责任。其他补充协议。
第三，两者的性质不同：
毕业生推荐表的性质是一种推荐材料，是学校正式向用人单位推荐毕业生的书面材料，具有较高的权威性和可信度。
就业协议书的是用人单位确认毕业生相关信息真实可靠以及接收毕业生的重要凭据，也是高校进行毕业生就业管理、编制就业方案以及毕业生办理就业落户手续等有关事项的重要依据。也是一种用工协议。