有机农业在提髙食品安全性、促进农产品出口等方面，具有积极 的意义；但发展有机农业，除了考虑食品安全、经济利益外，还应兼 顾其他相应的原则。专家认为，有机农业从业者只有坚持健康原则、 生态原则、公平原则和关爱原则等四大原则，才能有效推动有机农业 的稳步发展。
  健康原则。有机农业应当将土壤、植物、动物、人类和整个地 球的健康作为一个不可分割的整体而加以维持和加强。这一原则指的 是，个体与群体的健康是与生态系统的健康不可分割的，健康的土壤 可以生产出健康的作物，而健康的作物是健康的动物和健康的人类的 保障。
  健康是指一个有生命的系统的统一性和完整性。健康不仅仅是指 没有疾病，而是要维持系统的物质、精神、社会和生态利益。安全性、 顺应性和可再生性是健康的关键特征。有机农业在农作、加工、销售和消费中的作用，是维持和加强从 土壤中最小的生物直到人类的整个生态系统和生物的健康。
  有机农业 特别强调生产出高质量和富有营养的食品，为预防性的卫生保健事业作出贡献。为此，应避免使用那些对健康会产生不利影响的肥料、农 药、兽药和食品添加剂。生态原则。有机农业应以有生命的生态系统和生态循环为基 础，与之合作、与之协调，并帮助其持续生存。
  这一原则将有机农业 植根于有生命的生态系统中，强调有机农业生产应以生态过程和循环 利用为基础，通过具有特定的生产环境的生态来实现营养和福利方面 的需求。对于作物而言，这一生态就是有生命的土壤；对于动物而言, 这一生态就是农场生态系统；而对于淡水和海洋生物而言，这一生态 则是水生环境。
  有机种植、有机养殖和野生采集体系应与自然界的循环与生态平 衡相适应。这些循环虽然是常见的，但其情况却因地而异。有机管理 必须与当地的条件、生态、文化和规模相适应；应通过再利用、循环 利用和对物质及能源的有效管理，来减少投入物质的使用，从而维持 和改善环境质量、保护资源。
  有机农业应通过对农业体系的设计、提供生存环境和保持基因与 农业的多样性，来实现生态平衡。所有从事有机食品生产、加工、销 售及消费有机食品的人，都应为保护包括景观、气候、生物多样性、 大气和水在内的公共环境作出贡献。公平原则。有机农业应建立起能确保公平享受公共环境和生存 机遇的各种关系。
  
  公平是以对我们共有的世界的平等、尊重、公正和管理为特征的， 这一公平既体现在人类之间，也体现在人类与其他生命体之间。这一 原则强调所有从事有机农业的人，都应当以一种能确保对所有层面和 所有参与者(包括参与到有机农业中的所有农民、工人、加工者、分销 者、贸易者和消费者)都公平的方式来处理人际关系。