乙肝患者病情有轻有重，转归各有不同，有的“大三阳”患者活得长寿，而有的“小三阳”却发展为肝硬化或肝癌。其中原因除了患者遗传基因缺陷和机体免疫功能异常等因素外，还应考虑到乙肝病毒的基因分型。
通过检测乙肝患者血清中乙肝病毒脱氧核糖核酸的全长序列，发现每一个患者的基因组各有不同，但是依据患者血清检测的乙肝病毒核酸序歹。差异，大致可以将。肝病毒分易8个不同的基因类型(从A型到H型)，不同人种乙肝病毒基因类型各有不同，A型主要分布在北欧和美国,B型和C型主要分布在东亚，D型主要分布在中东、北非，E型主要分布在非洲，F型主要分布在南非，我国乙肝病毒基因类型以C型和B型为主。
我国乙肝患者多由母婴或父婴垂直传播而来，家系中直系血亲感染率较高，时一个家系中祖孙几代的乙肝患者携带的病毒核普酸序列进行检测，发现这些乙肝病毒基因序列同源性高达98%^100%。人类感染乙肝病毒后临床表现多种多样，非常复杂，有的发生隐性感染，有的发生急性肝炎，有的转化为慢性，长期不愈，有的发生暴发性肝炎;有的患者接受干扰素或拉米夫定治疗效果好，有的效果差。除了机体免疚应答存在个体差异外，不同的基因类型可能具有不同的毒力，有些病毒类型毒力强、破坏力大，有的毒力小、破坏力相对较轻。A基公类型对于干扰素治疗反应敏感，疗效较好，该类型发生肝硬化或肝癌的几率较小，这也是欧美国家乙肝患者预后大都良好的原因之一。大量研究表明C基因型携带者的肝脏炎症比B基因型严重，C基因型最常见于肝硬化及50岁以上肝癌患者。还有研究表明肝硬化患者以C和B基因混合型为主，提示乙肝病毒脱氧核糖核酸毒株的混合型有可能加重肝组织的损伤，也是慢性肝炎演变成肝硬化的原因之一。
