分泌褪黑素，分泌低糖因子，影响睡眠和觉醒。松果体位于间脑顶部，血运丰富，是重要的神经内分泌结构，它的功能主要包括：1，分泌褪黑素，抑制垂体促卵泡激素和黄体生成素的分泌，并分泌多种具有很强的抗促性腺激素作用的肽类激素，从而有效的抑制性腺活动和两性性征的出现，如果松果体受到损坏，则会出现性早熟和生殖器官的过度发育。2，分泌低血糖因子，其作用时间比胰岛素要长，可以达24小时。3，松果体的活动显示出明显的周期性，昼夜中褪黑素的分泌量随光照而减少，随黑暗而加多。因此，可以影响睡眠和觉醒活动，此外松果体的活动还呈现为月、季、年的周期性变化，从而影响机体的生物钟。
据研究，人脑底部的松果体对阳光变化十分敏感，往往会根据外界阳光的强弱来调节褪黑激素分泌量的多少
