与rRNA或核糖体亚基结合的蛋白质有二类。：一类与rRNA或核糖体亚基紧密连接，需高浓度盐和强解离剂（如3mol/LLiCl或4mol/L尿素）才能将其分离,这类蛋白质称为"真"核糖体蛋白质（"realribosomalproteins")或简称为核糖体蛋白质。
如E。coli30S亚基上的21种蛋白质及50S亚基上的34种蛋白质（共54种，因为小亚基上的S20与大亚基上的L26是相同）；或者在真核细胞40S亚基上的30种蛋白质及60S亚基上的45-50种蛋白质（共约80种），即属此类。而另一类蛋白质则为与有功能的核糖体亚基疏松缔合，能被0。
5mol/L单价阳离子（如K+,NH4+）从亚基上洗脱，并对核糖体循环发挥调节作用的蛋白质，如起始因子（IF或eIF)和延长因子（EF）等，称为核糖体相关蛋白质（proteinsassociatedwithribosome；简称PAR）。PAR不是构成核糖体的固有成分。
