色素性荨麻疹可以出现在毛囊、血管以及汗腺周围，有的也出现于其组织间隙中，色素性荨麻疹是一种肥大细胞病，有圆形或椭圆形色素斑或色素性结节，搔抓摩擦后变红发胀，所有各型均有特征性的肥大细胞聚集成群发生于真皮浅部的胶原纤维之间，肥大细胞的颗粒为粘多糖组成用Giemsa和甲苯胺蓝呈异染性，颗粒若丧失则肥大细胞即不易辨认。
色素性荨麻疹引起的皮损，在真皮上可以看到稀疏的肥大细胞的浸润，最常见的就是血管周围，肥大细胞呈梭形核，类似成纤维细胞，伴有有核的嗜酸性胞质。可见少数嗜酸细胞，其上方表皮基层中黑素增加。结节损害的皮损中，整个真皮有大量密集的肿瘤样肥大细胞浸润，常见到明显颗粒。
