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多数病毒性疾病均能自愈，少数严重感染者可致死亡。尚缺乏特效治疗，仍以全身支持疗法和对症治疗为主。用抗生素或磺胺治疗无效，一些抗病毒药物如碘脱氧尿嘧啶核苷（疱疹净）、阿糖腺苷、无环鸟苷对疱疹病毒感染等有一定疗效。干扰素为广谱抗病毒药，对DNA和RNA病毒均有抑制作用。三氮唑核苷（病毒唑）对某些病毒如流行性出血热病毒，可能有抑制作用。金刚烷胺可以预防流感。中草药对减轻一些病毒性疾病的症状、缩短病程可能有一定的疗效。
除隔离传染源、切断传染途径外，免疫预防是重要而有效的措施，有人工自动免疫如接种减毒活病毒疫苗（脊髓灰质炎疫苗、牛痘疫苗和麻疹疫苗等）及灭活病毒疫苗（流感疫苗、狂犬病疫苗等）。尤其是减毒活病毒疫苗的应用，常能获得持久、有效的预防效果。其次是人工被动免疫，注射病人恢复期血清及免疫球蛋白，可短期预防，如麻疹病人恢复期血清和丙种球蛋白预防麻疹，乙型肝炎高价免疫球蛋白预防乙型肝炎等。近年来已研究应用多肽疫苗及基因工程疫苗，有高效、安全、可以大量制备等优点，但尚须进一步研究及完善。
干扰素和干扰素诱生剂的应用
⒈干扰素 具广谱抗病毒作用.
⒉干扰素诱生剂 有poly I:C（多聚肌苷酸和多聚胞啶酸组成），甘草甜素，云芝多糖等.
⒊中草药防治病毒感染：如黄芪，板兰根，大青叶等能抑制多种病毒.
