疾病是由于卫生、防疫、消毒、饲养等措施不力引起，初生仔猪调节体温的机制和免疫力的先天不足，加之观察不细，发现和治疗不及时等，是构成新生仔猪死亡的多种原因。主要表现在以下五种情况。(1) 母猪本身的疾病引起的仔猪死亡一是，母猪免疫失败或未做某种疾病的疫苗免疫，如母猪在产前未做仔猪大肠杆菌疫苗免疫，产后初乳及常乳中缺乏抗大肠杆菌抗体，仔猪在出生后的20多天内易发黄、白痢等。
  二是,母猪带有强毒，母猪妊娠期间感染了伪狂犬、猪瘟、蓝耳病等病毒，除流产死胎外，产下的弱仔很难成活。尤其是母猪在妊娠后期感染伪狂犬或猪瘟病毒，在分娩时虽能产下看似健康的仔猪，但多在3~10天内死亡。即使有少数耐过，带有猪瘟病毒母猪产下的仔猪，即便做提前免疫也不能使仔猪产生抗体，最终发展成慢性猪瘟而死亡。
  三是，仔猪从初乳中被动获得的母源抗体不足，病原微生物很易侵袭，导致发病死亡。(2) 哺乳与保育期仔猪常发的疾病引起的死亡① 仔猪红痢多发生于1~3日龄，最急性型和急性型 1~3天死亡，亚急性和慢性型10天以内死亡，死亡率极高。② 仔猪黄痢多发生于5日龄以内仔猪。
  7天以上很少发病。③ 仔猪白痢10~20日龄仔猪常发。防治措施：一般妊娠母猪于产前2~3周肌内注射或耳根深层皮下接种仔猪大肠杆菌疫苗。初产母猪首免于产前5~7周，二免于产前15~ 20天。经产母猪每胎产前15天注射1次，配合仔猪红痢苗免疫。④ 猪水肿病引起的死亡本病主要危害断奶后及保育期仔猪，尤其发育良好、生长较快的仔猪。
  ⑤ 仔猪伪狂犬哺乳仔猪伪狂犬潜伏期一般为3~11 天。猪日龄、大小不同临床症状和严重程度也有差异。1月龄以下仔猪，尤其是15日龄以内仔猪发病率和死亡率都非常髙。⑥ 猪瘟哺乳仔猪猪瘟多为垂直传染即由母猪妊娠中后期间感染了猪瘟病毒，胚胎期间垂直传染给胎猪，使其出生时就带病毒。
  仔猪刚出生时，有部分仔猪看似正常，但生后1~ 7天便开始发病、死亡，严重者有神经症状，全身发抖，也有拖至断奶前后发病者，但都呈慢性经过，很难育成。⑦ 蓝耳病猪蓝耳病全称叫猪繁殖障碍与呼吸综合征。本病主要危害:一是对母猪造成严重流产，二是对仔猪造成严重的呼吸道危害。
  蓝耳病对哺乳仔猪和保育期仔猪的危害及临床症状、病变程度要比肥育猪和成猪大得多，尤其对新生仔猪的致死率非常髙。(3) 猪断奶后多系统衰竭综合征引起的死亡猪断奶后多系统衰竭综合征是断奶仔猪的一种新的传染病。本病的病原是一种最小的病毒圆环病毒。发病猪日龄多集中在6~16 周龄，8~12周龄仔猪最常见。
  (4) 管理不当引起的死亡冻死，仔猪调节体温的生理功能差，对温度变化敏感，在保温条件差的情况下，极易冻死仔猪；饿死，新生仔猪消化功能不完善，很容易引起饥饿。母猪产后少奶、奶质差或有效乳头少，致使仔猪不能尽早地吃到母乳或寄养不成功致仔猪因饥饿而死亡；踩压死，母猪母性差或产后患病，猪舍环境不安静，导致母猪脾气暴躁，引起母猪惊跑而弱小仔猪不能及时躲避被母猪压死或踩死。
  (5)其他因素如初生体重不足、咬死等。