环境因素鱼无公害养殖离不开水环境，水环境因素也成为影响 鱼无公害养殖质量安全的主要因素。随着经济的快速发 展，工业污染和生活污染越来越严重，这已成为世界性的 环境问题，包括水体的直接污染、陆地的污染和大气的污 染，但最终都将污染水体环境。而养鱼业的发展，由于养 殖的目标效益日益提高，在片面追求高产量的情况下，养 殖密度大大超过了养殖水体的正常载鱼量，其本身的生物 污染也日益严重，水质环境条件日益恶化，为病原体的繁 衍创造了有利的条件，必将造成养殖品种病害的增加，从 而影响了产品的质量。
  (二）种质因素鱼种是鱼无公害养殖发展的最重要物质基础,作为养殖的首要因素，其种质也成为发病的重要因素。随着养殖 面积的扩大、密度的提高，优质鱼种的培育不能与生产需 求同步增长，大多数养殖场都进行自繁自育，大部分品种 的种质退化现象相当严重，抗应激能力差，机体抵抗力下 降，生长性能减弱等，养成的水产品质量安全性能较差。
  (三）饲料因素饲料是鱼无公害养殖的物质基础，各养殖品种因其特 性不同对词料的营养需求也不同，而且同一品种在不同的 生长阶段对伺料的营养要求也不尽相同。由于我国对各 主要养殖品种的营养需求基础研究不够，加之伺料生产行 业管理不够健全，在很大程度上各伺料生产厂家各自为 政，标准不一，添加成分不同、原料差异较大，对养殖生产 造成了影响:一是营养性疾病，出现诸如脂肪肝、高糖肝等 肝脏病变，或是体内脂肪积累过多。
  二是造成养殖品种的 体质下降，易被病原体感染易发病，影响成活率，其结果是 养殖者增加用药量并造成残留量增加。三是水产品含有 对人体有害的物质。(四）药物因素在整个养殖过程中由于苗种、饲料、水质、温度、气候 等诸多因素的影响，养殖鱼类或多或少会有疾病发生，严 重的还会影响到成活率和产量，所以疾病的预防和治疗是 鱼无公害养殖中的一项重要工作。
  近年来，淡水鱼类的暴发性病流行极广，广大养殖户不断试用各种药物，由于使 用不当，养殖鱼类对药物的抗药性增强，防治效果下降。 一是为求得较好的防治效果，大量地增加药物的使用剂 量，不仅造成用药成本增加，而且极大地破坏了养殖鱼类 体内外正常微生物种群的平衡，增加了致病菌的耐药性。
   二是不合理的给药方式。大部分养殖鱼类对稳定的环境 依赖性较强，疾病的治疗应根据不同的病情和客观条件采 取适当的给药方式。