油菜昀茎属于直立茎秆，茎上密密麻麻分布有3#左右节间，茎秆木质化较强。完全成熟的主茎，长度有100-200厘米，主茎的颜色和品种有很大关系，有绿色、微紫色和深紫色 等多种。在油菜的生产管理中，油菜主茎粗壮粗细、长短以及直立或者弯曲，是衡量油菜植株强弱的重要形态指标，主茎粗壮的，直立且短的幼苗，植株长势好，产量高，被称为矮壮 苗，有利于安全越冬。
油菜茎的生长，分为3个时期，伸长期、充实期、物质转运期。在油菜幼苗期，油菜的主莲紧缩在一起，开春后，温度开始上升，油菜进人抽薹期，主茎伸长较快，节间渐次延伸长粗。根据观察，主茎平均每天伸长3厘米左右，最快的达到5-6 厘米，长势惊人，自始薹至终薹前的时间一般为20天左右，是茎秆迅速伸长期。
充实期，始花后茎轩贮藏的营异物质不断积累，干重也不断增加。物质转运期，是油菜角果发育成熟期间，植株内所含的营养成分发生分解转运，满足种子发育充实的需求。根据主莲的特征，主茎生长可划分为3种茎段：分别为缩茎段、伸长茎段、薹茎段。每 个茎段的生长特点各不相同。
缩茎段，位于主茎基部，与根部相接，节间短缩密集，圆形无棱，节上着生长柄叶。一般来说，缩莲段在正常栽培条件下不会伸长，但苗床幼苗过密、苗龄过长以及肥水充足的条 件下，往往会造成此段节间的伸长，这就是常见的高脚苗，生长瘦弱。伸长垄段，位于主莲中部，这部分的莲段的节间，由下而上依次由短变长，节后又一次由长变短，各节上着生短柄叶，叶痕比较宽，两段略微向下垂。
薹茎段，在主茎上部，顶端着生主花序轴，这部分的茎段的节间，由下而上依次缩短，有明显的棱。节省着生无柄叶，叶柄北部与茎粗相接处比较平整，叶痕比较宽，两端平伸。主茎在油菜的整个生长发育过程中，都发挥着重要的作用，向上输送根部的水分和营养，同时制造有机养料。
另外，连接根系与花叶果，且支撑枝叶，使其生长。
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