一、两者化学本质不同
VSEPR就是价层电子对互斥理论模型，价层电子对互斥模型是将共用电子对与孤对电子的概念，与原子轨道的概念相结合，且电子斥力达到最小。在这个模型中电子对相互排斥，成键电子与孤对电子距离越远越好。VSEPR模型以最简单的方法形象化了化学变化，也很容易判断物质的空间构型。
分子立体构型即分子的空间构型是指分子中各种基团或原子在空间分布的几何形状。分子中的原子不是杂乱无章地堆积在一起，而是按照一定规律结合的整体，使分子在空间呈现出一定的几何形状。如果确定了某分子内化学键的键长和键角数据，那么这个分子的几何构型就确立了。
二、两者化学特性不同
价层电子对互斥理论(英文VSEPR)，是一个用来预测单个共价分子形态的化学模型。理论通过计算中心原子的价层电子数和配位数来预测分子的几何构型，并构建一个合理的路易斯结构式来表示分子中所有键和孤对电子的位置。
分子立体构型进行sp杂化时，每个杂化轨道由1/2(ns)轨道和1/2(np)轨道组合而成，两个杂化轨道之间的夹角为180°。因此由sp杂化轨道构成的分子具有直线形的构型。同一个原子内的ns轨道与两个np轨道杂化，形成三个等同的sp2杂化轨道，并分别与自旋相反的电子结合。
扩展资料：
价层电子对互斥理论(VSEPR)的基础：
价层电子对互斥理论的基础是，分子或离子的几何构型主要决定于与中心原子相关的电子对之间的排斥作用。该电子对既可以是成键的，也可以是没有成键的（叫做孤对电子）。只有中心原子的价层电子才能够对分子的形状产生有意义的影响。
分子中电子对间的排斥的三种情况为：
1、孤对电子间的排斥（孤-孤排斥）
2、孤对电子和成键电子对之间的排斥（孤-成排斥）
3、成键电子对之间的排斥（成-成排斥）。
注：分子会尽力避免这些排斥来保持稳定。当排斥不能避免时，整个分子倾向于形成排斥最弱的结构。孤对电子间的排斥被认为大于孤对电子和成键电子对之间的排斥，后者又大于成键电子对之间的排斥。因此，分子更倾向于最弱的成-成排斥。
VSEPR与分子立体构型区别

空间构型（立体结构），几何构型表达的是分子中各原子间的相互位置的关系.VSEPR模型（构型）表达的是分子中中心原子周围电子对（成键电子对和孤对电子对）之间相互位置的关系譬如，PCl3 的空间构型（立体结构），几何构型是“三角锥”VSEPR模型（构型）是 正四面体 （sp3杂化) 
VSEPR与分子立体构型区别

有些有固对电子的VSEPR模型判断分子构型   和实际分子的空间构型不一致比如NH3   sp3杂化，VSEPR模型判断分子构型为四面体， 而实际通常称为三角锥