免费查重软件还有一些弊端就是，它们的数据库比不上收费软件的数据库。像中国知网，针对本科生毕业论文有着专门的大学生论文联合对比库，检测结果也是确保与学校无误。免费查重软件的话，检测出来的结果基本上只能作为一个参考，并没有太大价值。除了给自己一个心理安慰其它也没有什么。再一个就是关于毕业论文的保密性。这些免费检测的小网站的安全性、保密性都是无法保证的。可能你上传了论文，在检测之后，它会泄露出去，造成得不偿失的下场。
中国知网是选择收费最高的一个论文查重软件系统。很多同学写完论文以后，想要知道自己论文的查重率又不想花大价钱去检测，就会上网搜索免费论文查重软件。市面上的确存在这样子的查重软件，比如你注册个会员，送你一个几千字的论文免费检测机会。说实话，免费检测出来的结果，同学们还是会觉得不安心。因为这些提供免费检测机会的系统，它们的数据库肯定没有中国知网大，检测也没有中国知网那么全面。一个查重软件要生存发展，肯定需要成本来维护，修改系统。那些免费检测的网站靠什么运营。
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