楼主这个问题提得很好！为什么说好？因为近期网络上讨论中医问题比较多。而讨论中即有人提出一两千年前的中医理论是否陈旧的问题，反对中医的方舟子、张功耀等人就以中医理论是两千年前的作为理由，用来证明中医不科学。认为中医科学的人也以这些理论来作为理由说明中医科学。
前些天卫生部和中医药管理局的新闻发言人针对反中医言行指出原因：在于无知。
按鲁迅老先生的逻辑，论人论事不能过于向好的方向想，而应当向坏的方面多想想。如仅出于无知而反对一种广大群众所热爱的国粹，至少说是浅薄，往坏里想就是汉奸文化特务行为……
由于时间关系，下面简要谈一点张仲景、华佗等古中医理论和方法在当今的应用。《伤寒论》是张仲景的代表作，现在国内外中医界仍在一如既往地讨论，到图书馆随意翻看一下日本医学杂志，几乎百分之五十以上的篇幅在研讨伤寒论！！伤寒论的理论和药方在现今的中医临床上仍在广泛应用。
辨证方面，日本汉方医尤其是古方派，几乎完全采用三阴、三阳的辨证方法，将阴证、阳证确定为伤寒论三阴或三阳范围之内。这不仅用于外感热病，也广泛地运用于内伤杂病中。临床上，多在“方证相对”理论指导下，选择方剂。在方剂运用时，中日两国比较，我国用量（剂量）较大，日本用量较小。
辽宁科技出版社1982年5月第一版的《华佗神医秘传》彭静山点校本，内容有论病理方面的，有临床各症的治疗原则，也有方剂等。有许多中医运用其理论和方剂于疾病治疗中，效果很好。比如其“肺与大肠相表里”的论点也载于《中医大辞典》中，中医顶尖高手到美国一些医药研究机构讲课时，曾专门介绍中医的这个理论观点，美研究人员很虚心地学习并研讨该观点……
无论是张仲景还是华佗，流传下来的方剂中许多都是很有效的！什么是科学？有病治不了是科学？有病治好了，反而是伪科学？这是什么逻辑？
对于疾病来说，治好了就是科学！治好了才是硬道理！
方舟子、张功耀既不懂中医、也不了解西医，倒是口中念念有辞，大家想想他们是不是典型的某某功言行，什么病都不会治，还瞎嘟嘟科学，实在玷污了科学。
由于时间有限，所答内容较少，不足之处请谅解！
