基本的治疗计划取决于以下几个因素：你是首次感染，还是反复感染？是否有抗生素过敏问题存在？是否还有尚未发现的过敏之外的副作用？细菌类型是什么？药物敏感性如何？最后，感染是局限于膀胱，还是已蔓延到肾脏？尿路感染的成功治疗不仅依靠抗菌药物，更应注意纠正可能存在的易感因素，并鼓励病人采取一些自助的预防措施，这对经常复发的病人尤为重要。偶尔发作者只要保持足够的饮水量，辅以对症治疗，多数可以自愈。如果症状较重，伴有全身不适或腰部酸痛时，则需要给予抗菌药物。用药前应先做尿培养（最好两次）。如果医生怀疑感染只限于泌尿系下段，既没有高烧、寒战、腹胁痛，症状发作时间也短，也无近来未予治疗的感染，那么就可以采取单剂量治疗。大量研究结果表明，一次性大剂量抗生素治疗，对大多数限于膀胱的泌尿系感染是有效的。口服抗生素最有效，同时又可以维持阴道及肠道内细菌的生态平衡，例如曲美普林一美唑磺胺、单独使用曲美普林、头孢子素等。从已经得到的资料来看，门诊病人不论采用哪种药物，治愈率均为80%左右。大多数的抗生素以3天疗程的效果最好，与7天疗程的治愈率差不多，霉菌感染的副作用较少，花费也较低。延长用药时间未必能降低复发率，反而会筛选出对多种抗生素耐药的菌株，给今后的治疗增加困难。也可以单一剂量治疗，但是成功率较低，较容易复发，尤其是阿莫西林等很快就被身体代谢清除的药物，效果最差。研究显示，曲美普林在阴道分泌物里的浓度很高，足以杀光大肠杆菌，对阴道其他细菌的改变很小。但这一方法不能用于妊娠女性、男性或具有复杂的潜在疾病的患者，如患有糖尿病或肾结石等。住院期间特别是器械检查引起的尿路感染，常常对多种抗生素耐药，应根据敏感试验选用药物。在药物治疗期间，宜保证每日有2_-3000毫升的饮水量，鼓励多排尿，而且排尿务尽，这些措施在感染控制后数周内仍然需要。停药5-7天后宜再做尿细菌培养。
