要清除尖锐湿疣的组织，这是最直观也是最初步的一步。所采用的方法有外用疗法，如采用冷冻、激光、微波、电烧等物理疗法和手术治疗。药物治疗。应该使用正确的药物对患者的患处进行治疗，反复用药物涂搽尖锐湿疣损害和损伤的表皮，使表皮内的HPV抗原暴露于真皮内的免疫系统，从而建立和发挥完整的免疫功能，以清除疣组织。
提高病人的免疫力。这一步才是最关键的，病人的免疫力提高了，就会远离疾病。提高患者机体抗HPV感染的能力，所采用的方法是全身性或局部性免疫疗法等。如采用干扰素治疗尖锐湿疣时，可与其他方法联合应用，或用其他方法去除疣体后再用干扰素，以达到辅助治疗或减小复发的目的。
