特种稻米具有天然色素和营养丰富两大特点，对土壤特性和肥水条件有其独特的要求。有的品种必须在一定的土壤、气候条件下，才能表现出它的特性，如云南的软米等。黑米富含铁、铜、锌、锰等微量元素，在栽培中必须补充这些微量元素以维持土壤供肥能力。化肥对水稻品质、土壤结构及理化性状影响较大，同时大量施用化肥、农药也会污染环境。因此，种植特种稻的肥料，应以微肥和微生物肥料，或以有机肥为主，辅之以化肥。增施锌肥能提高香米的香味，施锌、铜、铁肥可以提高黑米品质产量。在病虫防治方面应注重综合防治，尽量不施或少施农药，以免影响特种稻米的品质。
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