第1护卫队群
司令部：横须贺
由于从事公关活动多，故被称为“公关的1群”。第1护卫队群经常是配备最新锐舰的编队。
包括：
第1护卫队
DDH-181 日向（ひゅうが）
DDG-172 岛风（しまかぜ）
DD-107 雷（いかづち）
DD-101 村雨（むらさめ）
第5护卫队
DDG-173 金刚（こんごう）
DD-108 曙（あけぼの）
DD-157 泽雾（さわぎり）
DD-115 秋月（あきづき）
第2护卫队群
司令部：长崎县佐世保市
别称“训练的2群”，训练频率高。
另外当地九州出身的人很多，生活环境相对稳定士气和高。第2护卫队群是被编在日本与韩国、中国接壤海域的精锐部队。
包括：
第2护卫队
DDH-144 鞍马（くらま）
DDG-178 足柄（あしがら）
DD-102 春雨（はるさめ）
DD-154 天雾（あまぎり）
第6护卫队
DDG-176 鸟海（ちょうかい）
DD-110 高波（たかなみ）
DD-111 大波（おおなみ）
DD-116 照月（てるづき）
第3护卫队群
司令部：京都府舞鹤市
被称为“乡下的3群”，作为与北朝鲜、俄罗斯接续海域的最前线部队，也是上级指挥官晋升的龙门，因此又称“书类的3群”。
包括：
第3护卫队
DDH-143 白根（しらね）
DDG-177 爱宕（あたご）
DD-112 卷波（まきなみ）
DD-114 凉波（すずなみ）
第7护卫队
DDG-175 妙高 （みょうこう）
DD-103 夕立（ゆうだち）
DD-156 濑户（せとぎり）
DD-109 有明（ありあけ）
第4护卫队群
司令部：广岛县吴市
别称“不行的4群”，在温暖的濑户内海作为战略预备部队，也别名“修理的4群”，因为部队多配备旧舰。
包括：
第4护卫队（大凑）
DDH-182 伊势（いせ）
DDG-171 旗风（はたかぜ）
DD-106 五月雨（さみだれ）
DD-158 海雾（うみぎり）
第8护卫队（吴）
DDG-174 雾岛（きりしま）
DD-104 雾雨（きりさめ）
DD-105 电（いなづま）
DD-113 涟（さざなみ）
地方配备部队：
第11护卫队（横须贺）
DD-129 山雪（やまゆき）
DD-152 山雾号（やまぎり）
DD-153 夕雾（ゆうぎり）
第12护卫队（吴）
DE-229 阿武隈（あぶくま）
DE-232 川内（せんだい）
DE-234 利根（とね）
第13护卫队（佐世保）
DD-127 叽雪（いそゆき）
DD-128 春雪（はるゆき）
DD-132 朝雪（あさゆき）
DE-230 神通（じんつう）
第14护卫队（舞鹤）
DD-151 朝雾（あさぎり）
DD-130 松雪（まつゆき）
第15护卫队（大凑）
DD-155 滨雾（はまぎり）
DE-231 大淀（おおよど）
DE-233 筑摩（ちくま）
潜水舰队：
第1练习潜水队（吴）
TSS-3601 朝潮（あさしお） 练习潜水舰（原春潮级SS-589 第一艘AIP潜水舰）
TSS-3607 冬潮（ふゆしお）（原春潮级SS-588）
第1潜水队群
司令部：吴
直辖舰 ASR-403 千早（ちはや）潜水舰救难舰
第1潜水队
SS-591 满潮（みちしお）
SS-593 卷潮（まきしお）
SS-594 矶潮（いそしお）
第3潜水队
SS-504 剑龙（けんりゅう）
SS-596 黒潮（くろしお）
SS-600 望潮（もちしお）
第5潜水队
SS-501 苍龙（そうりゅう）
SS-502 云龙（うんりゅう）
SS-503 白龙（はくりゅう）
第2潜水队群
司令部：横须贺
直辖舰 ASR-405 千代田（ちよだ）潜水舰救难舰
第2潜水队
SS-590 亲潮（おやしお）
SS-592 涡潮（うずしお）
SS-595 鸣潮（なるしお）
第4潜水队
SS-505 瑞龙（ずいりゅう）
SS-597 高潮（たかしお）
SS-598 八重潮（やえしお）
SS-599 瀬户潮（せとしお）
练习舰队
司令部：吴
直辖舰艇 练习舰 TV-3508 鹿岛（かしま）
第1练习队
TV-3513 岛雪（しまゆき，原DD-133）
TV-3517 白雪（しらゆき，原DD-123）
TV-3518 濑户雪（せとゆき，原DD-131）
第1训练支援队（驻广岛县吴市）
AST-4202 黑部 （くろべ）
AST-4203 龙 （てんりゅう）
第1输送队（驻广岛县吴市）
LST-4001 大隅 （おおすみ）
LST-4002 下北 （しもきた）
LST-4003 国东 （くにさき）
第1海上补给队
十和田级15850吨
AOE-422 十和田 （とわだ）
AOE-423 常磬 （ときわ）
AOE-424 滨名 （はまな）
摩周级25000吨
AOE-425 摩周 （ましゅう）
AOE-426 淡海 （おうみ）。
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