女性也会出现尖锐湿疣，一般早期症状并不是很突出，患者的病变部位主要是外阴周围或女性生殖道内部，少数患者的口腔粘膜、足趾缝间、胸部、脐窝等处也会出现疣体。但这些患者属接触传染，不属性病范畴。临床经验表明出现在宫颈口的疣体是最易被忽略的。
男性尖锐湿疣初期症状不是非常明显，一般情况下，患者的病变部位主要有肛部、男性生殖器或阴囊。其中尿道口是最常见的病变部位，尿道口的疣状赘生物表面呈光滑或乳头瘤样，表面湿润，颜色潮紅。患者在进行检查时，需将尿道口粘膜充分暴露，才能看见疣体。有时PV病毒会沿尿道逆行向上，致使尿道上皮被感染，此时需作尿道镜检查。
