从广义讲，动物疾病研究的对象涉及与人类有关的一切动物。但兽医工作者通常以与人类关系最密切、经济价值最大的家畜疾病为研究和防治的主要对象。动物疾病可以有不同的分类方法。根据疾病性质的分类主要可分下列3大类：动物疾病传染病其病原包括病毒、细菌、立克次氏体、衣原体、霉形体和真菌等微生物。特点是：①每一种传染病都由一种特定的微生物所引起，而且宿主谱宽窄各不相同。如猪瘟和炭疽分别是由猪瘟病毒和炭疽杆菌所引起的；猪瘟只能感染猪属动物，而炭疽则几乎能感染所有哺乳动物，包括人类。②具有传染性。病原微生物能通过直接接触(舐、咬、交配等)，间接接触（空气、饮水、饲料、土壤、授精精液等），死物媒介（畜舍用具、污染的手术器械等），活体媒介（节肢动物、啮齿动物、飞禽、人类等）从受感染的动物传于健康动物，引起同样疾病。③分别侵害一定的器官、系统甚或全身，表现特有的病理变化和临诊症状。④动物受感染后多能产生免疫生物学反应（免疫性和变态反应），人类可借此创造各种方法来进行传染病的诊断、治疗和预防（见家畜传染病）。寄生虫病寄生虫主要包括原虫、蠕虫和节肢动物3大类。前二者多为内寄生虫，后者绝大多数为外寄生虫。寄生虫多有较长的发育期和较复杂的生活史，有的需要在一种、甚至几种宿主体内完成其发育，多数寄生虫都有其固定的终宿主。它们可以通过直接接触(如疥螨、马媾疫锥虫、钩虫丝状蚴、血吸虫尾蚴)，吞入含感染性虫卵、幼虫或卵囊等的土壤、饮水或饲料（例如蛔虫、圆线虫、球虫）以及蜱、虻等外寄生虫作媒介（例如血液原虫）而传播（见家畜寄生虫病）。普通病主要包括内科、外科和产科疾病3类。内科疾病有消化、呼吸（家畜）、泌尿、神经、心血管、血液造血器官、内分泌、皮肤、肌肉、骨骼等系统以及营养代谢、中毒、遗传、免疫、幼畜疾病等，其病因和表现多种多样。外科疾病主要有外伤、四肢病、蹄病、眼病等。产科疾病可根据其发生时期分为怀孕期疾病（流产、死胎等），分娩期疾病（难产），产后期疾病（胎衣不下、子宫内膜炎、生产瘫痪）以及乳房疾病、新生幼畜疾病等。随着畜牧业对家畜繁殖率和家畜品质要求的提高，产科学的领域已扩展到人工授精、胚胎移植以及交配和输精感染及不育症的防治等，从而又分化出母畜科分支（见家畜内科病，兽医产科）。但上述分类并非绝对的。有些原虫所致的疾病如球虫病、弓形虫病、梨形虫病和锥虫病等由于传播、流行和表现方式与传染病非常相似，有些学者也将其归入传染病。由蟠尾丝虫侵害马项韧带所致的鬐甲瘘，既是一种寄生虫病，又可归属于外科病。肿瘤之能用手术切除者属于外科疾病，非手术所能达到者为内科疾病。至于因重视幼畜的培育及强调幼畜的解剖生理特点而设置的幼畜病分支，其内容则传染病、寄生虫病和普通病三类俱备。分类为便于叙述和应用，并无不可逾越的界限。根据同时发病动物多少的分类可分为群发病和散发病两类。一般传染病、寄生虫病、中毒和营养缺乏病多为群发，但也有例外，如破伤风虽为一种传染病，但必需有破伤风梭菌存在于缺氧的深创伤中才能发生，故仅散发。有些传染病如钩端螺旋体病以及部分寄生虫病，如弓形虫病和血吸虫病在畜群中常表现为隐性感染，多属散发，仅偶有群发。在群发疾病中，又可根据其流行方式分为地方性、流行性和大流行性疾病。普通病虽多为散发，但某些中毒疾病和营养缺乏、特别是微量元素缺乏疾病，由于其病因多与某一地区饲料和土壤的特性有关，亦常呈地方性流行。在传染病和寄生虫病中，有的因其病原(例如炭疽杆菌、恶性水肿梭菌及其芽孢)常存在于某一地区的土壤中，或者其中间宿主（如含血吸虫尾蚴的螺、带梨形虫的蜱）只限于某一水域或者地区中，所以只呈地方性流行。但大多数烈性传染病如牛瘟、猪瘟、鸡新城疫等常同时在广大地区蔓延发生，以流行性疾病著称；其中部分尚可同时迅速在洲际散播，构成大流行或世界性流行。其他分类动物疾病还可分为本土疾病和外来疾病。在国际交往频繁，旅游和贸易十分发达的情况下，外来疾病常通过各种交通工具中的蚊、蝇、蚤、虱、臭虫、蟑螂、老鼠和伴随动物、进口的家畜和野兽、冷冻精液和胚胎，以及畜产品和其他货物传入本国。严防外来的动物疾病，已成为国境和口岸检疫的重要任务。
