由于目前没有特效的抗病毒药物，尖锐湿疣的治疗必须采用综合治疗。
（一）治疗诱因：（白带过多，包皮过长
、淋病）。
（二）提高机体免疫力。
（三）应用抗病药物。一般只要坚持规则的综合治疗可以达到临床痊愈，但复发几率90%以上。
1、手术疗法 对于单发、面积小的湿疣，可手术切除；对巨大尖锐湿疣，可用Mohs氏手术切除，手术时用冷冻切片检查损害是否切除干净，单一手术复发几率很高。
2、冷冻疗法 利用-196℃低温的液体氮，采用压冻法治疗尖锐湿疣，促进疣组织坏死脱落，本法适用于数量少，面积小的湿疣，可行1-2次治疗，间隔时间为一周,这种方法一般可以清除疣体，容易复发。
3、激光治疗 通常用CO2激光，采用烧灼法治疗尖锐湿疣，本疗法最适用女阴、阴茎或肛周的湿疣。对单发或少量多发湿疣可行一次性治疗，对多发或面积大的湿疣可2-3次治疗，一般在复发周期20天-3个月。
4、 电灼治疗 采用高频电针或电刀切除湿疣。方法：局部麻醉，然后电灼，本疗法适应数量少，面积小的湿疣，这种方法只是清除疣体。
5、微波治疗 采用微波手术治疗机，利多卡因局麻，将杆状辐射探头尖端插入尖锐湿直达疣体基底，当看到疣体变小、颜色变暗、由软变硬时，则热辐射凝固完成，即可抽出探头。凝固的病灶可以用镊子挟除。为防止复发，可对残存的基底部重复凝固一次。
6、β-射线治疗 我们应用β-射线治疗尖锐湿疣取得了较为满意的效果，该方法疗效高，无痛苦、无损伤、副作用少，复发率在80%以上，在临床上有一定推广价值。
7、药物疗法
（1）抗病毒药：可用5%酞丁胺霜剂，或用0.25%疱疹净软膏，每日2次，外涂。无环鸟苷口服，每日5次，每次200mg，或用其软膏外用，α-干扰素每日注射300万单位,每周用药五天。或干扰素300万单位注入疣体基部，每周2次。连用2-3周，主要副作用为流感样综合症，这种方法复发几率很高.
（2）腐蚀剂或消毒剂：常用有30%-50%三氯醋酸或饱和二氯醋酸，或18%过氧乙酸。用10%水杨酸冰醋酸或40%甲醛、2%液化酚、75%乙醇蒸馏水100ml混合溶液，点涂局部，用于龟头、肛周湿疣，每日或隔日一次，效果甚好。消毒剂可用20%碘酊外涂，或2.5-5%碘酊注射于疣体基部，每次0.1-1.5ml，或用新洁尔灭外涂或以0.1-0.2%外敷，后者需配合全身疗法，清除疣体还是不错的。
（3）抗癌药 ①5-氟脲嘧啶(5-F u)：一般外用5%软膏或霜剂，每日2次，3周为一疗程。2.5%~5%氟脲嘧啶湿敷治疗阴茎、肛周尖锐湿疣，每次敷20分钟，每日一次，6次为一疗程。也可用聚乙二醇作基质，加入占其干质5%的5- F u粉剂制成栓剂，治疗男女尿道内尖锐湿疣，也可用5- F u基底注射，多者可分批注射。 ② 噻替哌：主要用于5-F u治疗失败的尿道内尖锐湿疣，每日用栓剂（每个含15mg），连用8天，也可将本品60mg加入10-15ml消毒水中，每周向尿道内滴注，保持半小时，副作用有尿道炎。亦可用本品10mg加入10ml浸泡患处，每日3次，每次半小时，治疗阴茎、龟头冠状沟湿疣，主要用于经其它方法治疗后，尚有残存疣体或复发者。也可将此溶液再稀释两倍浸泡局部，以预防复发。 ③ 秋水仙碱：可用2-8%的生理盐水溶液外涂，涂两次，间隔72小时治疗阴茎湿疣，涂后可出现表浅糜烂。
中医治疗尖锐湿疣
由于中医治疗取材方便，治疗彻底，目前仍有很多尖锐湿疣患者接受中医治疗。中医根据患者的体质和疣体的大小，结合全身症状，常划分为3型论治。它们是湿热下注证、外染毒邪证和气血瘀滞证。湿热下注证常发生于素体肥胖，阴部潮湿的患者；外染毒邪证常发生于不洁性交的患者；而气血瘀滞证主要见于湿疣日久，疣体灰暗的患者。 １、湿热下注证 湿热下注证或有肛周皮损潮湿红润，或有包皮过长，或有白带过多或其他皮肤病。常伴口苦、口粘、口渴不喜饮水，大便粘滞不畅，小便黄。舌红苔黄腻，脉弦数。这是由于肝胆湿热下注，循经流注阴部所致。治疗宜清利湿热，解毒消疣，方药如下： 苍术10g 黄柏10g 生苡仁30g 土茯苓30g 丹皮10g 通草10g 泽泻10g 马齿苋30g 。方中苍术、黄柏清下焦湿热；生苡仁健脾除湿，具有抗病毒的功能；配土茯苓、丹皮、通草、泽泻、马齿苋解毒除湿，活血化瘀。如湿热重者，可加入龙胆草10g；大便不通者，可加入芦荟10g。 2、外染毒邪证 常见疣体增大迅速，有明确的不洁性交史。自觉症状常较轻或无，舌脉亦可正常。这是由于外染毒邪，毒气蕴滞，故疣体增大迅速。治疗宜清热解毒，常用方药为去疣三号方加减： 马齿苋60g 败酱草15g 紫草15g 大青叶15g 木贼草15g 。方中马齿苋为主药，清热解毒；配合败酱草、紫草、大青叶、木贼草加强清热解毒、活血散结之效。如皮损灰暗，或病程较长，酌加蜂房、丹参、红花等活血化瘀之品。 3、血瘀滞证 见于皮损暗红或暗褐色，增长缓慢，经久不消，或有疼痛的患者。舌暗淡，苔薄白，脉细涩。这是由于毒邪结聚日久，阻滞气机，致气血瘀阻所致。治疗宜理气活血、化瘀散结，常用方为桃红四物汤加减： 桃仁10g 红花10g 川芎10g 当归10g 白芍10g 丹参10g 蜂房10g 柴胡10g 夏枯草30g 。方中取桃仁、红花、川芎、当归、丹参、蜂房活血化瘀；柴胡疏肝理气，引药直达病所；夏枯草清热解毒，软坚散结。如患者为气虚者，可加入生黄芪30g，补气解毒，提高机体免疫力；疣体坚硬者，可加入生龙牡各30g以软坚散结。 穿山甲,川黄连,败酱草,赤芍,铁胆粉,海南沉,黄芪,板蓝根,野菊花,生地,茵陈.水煎服或粉碎装零号胶囊,一日三次。 西胡椒30g,薄荷水5g,五倍子20g,共研细末,过100目筛备用.用时取少许药粉敷患处,用手揉搓片刻,局部有麻凉,蛰痛等感觉,其程度因人而异,一般持续15~60分钟,每日用药数次。
