人工感染的潜伏期为18～36小时，自然感染的潜伏期长，有母源抗体的幼雏潜伏期可达6天以上。雏鸡突然出现呼吸症状并很快波及全群，病鸡表现为气喘、咳嗽、打喷嚏、气管鸣音和流鼻涕，精神沉郁、畏寒、食欲减少、羽毛松乱、打堆，个别鸡鼻窦肿胀、流泪。6周龄以上的鸡症状不明显，主要是气管鸣音、喘气和轻微咳嗽等。蛋鸡产蛋量下降，并产软壳蛋、畸形蛋或粗壳蛋，蛋白稀薄如水样，蛋黄与蛋白分离以及蛋白粘壳等。肾病理变化型传染性支气管炎是目前发生多、流行范围较广的疾病，20～30日龄是其高发阶段。病初，病鸡表现怕冷、喷嚏和咳嗽，有的张口喘气及气管鸣音，2～3天后出明显的全身症状，表现为厌食、拱背、饮水量增大，拉白色水样粪便，粪便中含有大量尿酸盐。病鸡失水，肌肉干燥，冠髯及皮肤发绀。出现上述症状2～3天后开始死亡，7天后达到死亡高峰，逐渐至15～17天停止死亡，发病日龄越小，死亡率越高，成年鸡很少发病。本病发病率高，雏鸡的死亡率为25％，6周龄以上的鸡死亡率低，感染肾型毒株一般死亡严重。病程一般为1～2周。
传染性支气管炎的临床表现比较复杂。这一方面是由于IBV本身变异快、血清型多造成的，另一方面也与环境中的其他致病因子（如大肠杆菌、支原体等）混合感染，以及不良的饲养管理因素（如滥用抗生素、饲料配比失当等）有关。
呼吸型：鸡群往往发病突然。4周龄以下的幼鸡主要表现为伸颈、张口呼吸、咳嗽、打喷嚏、呼吸啰音等症状。2周龄以内的鸡，还常见鼻窦肿胀、流鼻液、流泪、频频甩头等。病情严重时，病鸡精神沉郁、食欲废绝、羽毛松乱、体温升高、怕冷扎堆，甚至引起死亡。康复鸡则大多发育不良，形体消瘦，蛋雏鸡还会因输卵管损伤而严重影响或完全丧失产蛋能力。5～6周龄以上的鸡发病症状与幼鸡相似，但因气管内滞留大量分泌物而造成的“咕噜”异常呼吸音更明显，尤以夜间最清晰。另外，较少见到流鼻液的现象。这种呼吸道症状可持续7d～14d，同时有黄白色或绿色下痢，但死亡率比幼雏低。
成年鸡感染IB后的呼吸道症状较轻微，相比之下产蛋性能的变化更明显。主要表现为开产期推迟，产蛋量明显下降，降幅在25%～50%之间，可持续4～8周。同时畸形蛋、软壳蛋、粗壳蛋增多。蛋的品质也下降，蛋清稀薄如水，蛋黄与蛋清分离。康复后的蛋鸡产蛋量很难恢复到患病前的水平。
肾型：主要发生于2～4周龄的鸡。最初表现短期（约1d～4d）的轻微呼吸道症状，包括啰音、喷嚏、咳嗽等，但只有在夜间才较明显。如无混合感染导致的明显症状，常常容易被忽视。呼吸道症状消失后不久，鸡群会突然大量发病，出现厌食、口渴、精神不振、拱背扎堆等症状，同时排出水样白色稀粪，内含大量尿酸盐，肛门周围羽毛污浊。病鸡因脱水而体重减轻、胸肌发绀，重者鸡冠、面部及全身皮肤颜色发暗。发病10d～12d达到死亡高峰，21d后死亡停止，死亡率约30%。产蛋鸡感染后也会引起产蛋量下降、产异常蛋和死胚率增加，但死亡不多。
