痛经的确切病因至今尚不明确，没有一个理论能全面解释此症候群。不同的患者对治疗有不同的反应，考虑病因可能是多方面的。
很久以来，大家都知道痛经与排卵的月经周期有关。痛经的机制与前列腺素活性有关。痛经患者体内的前列腺素的含量高于没有痛经的患者。前列腺素(PG)释放增加：分泌期子宫内膜及血中PGF2a异常升高,诱发子宫肌收缩/产生痉挛性疼痛;同时可引起胃肠道反应。催产素是目前所知的一种最强烈的子宫收缩剂，通过催产素与其受体与G蛋白相耦联后，激活磷脂酶C，通过细胞内的磷酸肌醇信号系统，诱导细胞质Ca2+浓度升高，导致子宫在分娩时强烈收缩。此外，催产素可能作用在子宫动脉，近年来的研究表明催产素在子宫动脉的收缩中可能起到重要作用，除调节子宫的正常功能外，催产素可产生子宫暂时性缺血，这种机制亦可能参与原发痛经的发生。
其他研究证实增多的白细胞三烯与痛经相关。血管加压素升高：晚黄体期雌激素水平高者,刺激垂体后叶释放过量血管加压素,引起子宫过度收缩。
精神因素可能也是痛经的原因之一，包括母亲对女儿的影响。女孩最好在月经初潮前能够了解月经的相关信息，这些信息可以由父母、老师或医生来传达。来自于学习或社会方面的焦虑情绪可能也是原因之一。同时，有报道约50%患者仅用安慰剂可缓解症状。
痛经时卧床休息，可以热敷下腹部。可服食非甾体类抗炎药：
药物 剂量
布洛芬（ibuprofen） 200-800mg，tid to qid
甲灭酸（Mefenamic acid） 首剂500mg，250mg，qid
萘普生（naproxen） 250-500mg，bid
双氯芬酸（Diclofenac） 50mg，bid to tid
酮基布洛芬(Ketoprofen) 25-75mg，tid to qid
消炎痛（indomethacin） 25-50mg，tid to qid
氟灭酸（flufenamic acid） 100-200mg，tid to qid
COX-2抑制剂 200mg，bid
