流行性腮腺炎的严重并发症如下：
（1）神经系统并发症：①无菌性脑膜炎、脑膜脑炎、脑炎：为常见的并发症，尤多见于儿童患者，男孩多于女孩。腮腺炎时脑炎的发病率约0.3%〜8.2%;②多发性神经炎、脊髓灰质炎等：偶有腮腺炎后1〜3周出现多发性神经炎、脊髓灰质炎，预后多良好。肿大的腮腺可能压迫面神经引起暂时性面神经麻痹。有时出现平衡失调、三叉神经炎、偏瘫、截瘫、上升性麻痹等。偶有腮腺炎后因导水管狭窄而并发脑积水者；③耳聋：为听神经受累所致。发病率虽不高（约1/15000)，但可成为永久性和完全性耳聋，所幸75%为单侧性，故影响较小些。
（2）生殖系统并发症：腮腺炎病毒好侵犯成熟的生殖腺体，故多见于青春期后期以后的患者，小儿少见。①睾丸炎：发病率占男性成人患者的14%〜35%，常发生在腮腺肿大1周左右开始消退时，突发高热、寒战、睾丸胀痛，伴剧烈触痛，症状轻重不一，一般约10天消退。阴囊皮肤水肿也显著，鞘膜腔内可有黄色积液。病变大多侵犯一侧，约1/3〜1/2的病例发生不同程度的睾丸萎缩，由于病变常为单侧，即使双侧也仅部分曲精管受累，故很少引致不育症。附睾炎
常合并发生；②卵巢炎：约占成人女性患者的5%〜7%。症状较轻，不影响受孕，严重者可扪及肿大的卵巢伴压痛。迄今尚未见因此导致不育的报告。
（3）胰腺炎：约见于5%成人患者。儿童中少见。常发生于腮腺肿胀后3〜4天至1周，胰腺炎症状多在1周内消失。血淀粉酶不宜作诊断依据。血清脂肪酶值超过25.Olμmol/L(1500U/L)[正常参考值为3.33〜11.67μmol/L(200〜700U/L)]，提示最近发生过胰腺炎。脂肪酶通常在发病后72小时升高，故早期诊断价值不大。近年来随着儿童患者病情越来越重，胰腺炎的并发症也随之增高。
（4）肾炎：早期病例尿中绝大多数可分离出腮腺炎病毒，故认为该病毒可直接损害肾脏，轻者尿中有少量蛋白质，重者尿常规及临床表现与肾炎相仿，个别严重者可发坐急性肾衰竭而死亡，但大多数预后良好。
（5）心肌炎：约4%〜5%患者并发心肌炎。多见于病程第5天至第10天，可与腮腺肿同时或恢复期发生。心电图可见窦性停搏、房室传导阻滞、ST段压低、T波低平或倒置、期前收缩等，严重者可致死。大多数仅有心电图改变（3%〜115%)而无明显临床症状，偶有心包炎。
其他：乳腺炎（15岁以上女性患者31%并发此症）、骨髓炎、肝炎、肺炎、前列腺炎、前庭大腺炎、甲状腺炎、胸腺炎、血小板减少、荨麻疹、急性滤泡性结膜炎等均少见。关节炎发病率约为0.44%，主要累及肘、膝等大关节，可持续2天至3个月不等，能完全恢复。多发生于腮腺肿后1〜2周内，也有无腮腺肿者。
