由于大股东对于公司具有控制力和支配力，相对处于弱势的中小股东的利益与大股东发生冲突就成了一个亟待解决的问题。
一、对于中小股东的侵害，目前主要是来自两方面的侵害，一方面是公司管理层对中小股东的侵害，主要表现为1、违反法律或者规章故意拖延或者拒发股利；2、不合理向董事或者控股股东担任的高管支付高额报酬和福利；3、用公司的财产为控股股东提供优惠贷款或者高价租其财产；4、对于中小股东隐瞒企业的相关信息等等等等。
  另一方面是大股东对中小股东的侵害，主要表现为1、大股东滥用其表决权；2、为中小股东出席股东大会设置不合理的条件；3、任意罢免或者阻挠中小股东担任高管职务；4、任意决策和实施公司的重大事项；5通过关联交易增加大股东的收益减少大股东的风险和损失等等等。
  
二、针对越来越严重的损害中小股东利益的行为，我国新的《公司法》对保护中小股东合法权益设定了保护条款。
（1）、保护中小股东利益的事前防范措施。我国《公司法》修订后规定了股东知情权、质询权、股东对股东大会召开的请求权、召集权、提案权以及关联交易表决权的回避等保护中小股东利益的举措。
  比如我国《公司法》第97条、117条就规定了股东知情权，股东行使知情权、质询权是股东表达其真实意思的基础，也只有在对公司真实情况进行掌握的情况下，才能防患于未然，把中小股东的损害降至最低甚至没有。又如《公司法》第16条、125条规定了关联交易的表决权回避，试想若没有该原则的确立，公司大股东或实际控制人可以轻易的把公司资产转移或滥用股东权利谋取私利，会严重损害到中小股东的权益。
  
（2）保护中小股东利益的事后救济措施。
虽然我国《公司法》在修订后对保护中小股东利益作出了诸多规定，但是仍然不能照顾到方方面面，仍然有制度缺失的地方，仍然会有部分中小股东利益受到侵害的情况，因此，我们总结出对于中小股东利益受到侵害的情况下的救济途径。
  
①异议股东股份回购请求权。《公司法》第143条规定了异议股东股份回购请求权，该条是对中小股东在对可能影响自己切身利益的重大事项决策持异议，可以请求公司回购其股份。
②利益受到侵犯的股东可以直接提起诉讼。
股东直接诉讼，是指股东基于股份所有人的地位，为了维护自身利益对公司或者其他权利侵害人提起的诉讼。
  我国《公司法》153条对此做了详细的规定。
③股东可以代位诉讼。
股东代位诉讼又称为股东派生诉讼，是指当公司的合法权益受到不法侵害而公司却怠于起诉时，为了保护公司的整体利益，公司的股东以自己的名义代表公司提起的诉讼。《公司法》第152条对股东派生诉讼作出详细规定。
  股东代位诉讼的意义在于中小股东可以在特定的情况下直接代表公司进行诉讼，以防公司大股东滥用权利损害公司利益的时候没有救济途径，致使公司利益遭受损失，也相应的会损害中小股东的利益。
④股东解散公司诉讼。
股东解散公司诉讼是以消灭公司人格为目的的诉讼，往往是在股东用尽所有的救济途径仍不能挽回利益的情况下行使的。
  《公司法》183条规定，公司经营管理发生严重困难，继续存续会使股东利益受到重大损失，通过其他途径不能解决的，持有公司全部股东表决权10%以上的股东，可以请求人民法院解散公司。
总体来说，我国《公司法》修订以后，对中小股东利益的诸多保护措施，但司法实践中，由于法律不能照顾到方方面面，中小股东利益还是会不同程度的受到侵犯，律师根据具体的案例，结合我国法律新修订内容，充分的运用结合，能更好的保护中小股东的利益。