洗牙时使用的超声洁治的工作头本身并没有任何切削功能，它是靠超声波的高频振动来击碎牙石，且医生操作时要不断移动工作头，也没有加压，只是轻轻接触牙石，这样是不会损伤牙齿的。但如果操作不当，如加压或在牙面上停留时间过久，会在牙面上留下细小划痕，一般在显微镜下可见细微的粗糙面，这种划痕可通过抛光来弥补。
有人在洗牙过程中会觉得牙齿酸痛，这主要是牙根暴露所致，而牙根暴露是牙周病的一种典型表现。牙根对冷、热、酸、甜等刺激均较敏感。因此，牙周炎症越重，牙根暴露可能越明显，在治疗中的酸痛感也会越明显。
另外，有的患者在洗牙后还会出现牙齿敏感，这主要是在洁治前，暴露的牙根被牙石包绕，隔断了冷热刺激。为减少痛苦，可在洁治后短期内避免接触过冷、过热食物，使牙齿有个适应过程，症状就会有所缓解。
还有许多人在洗牙过程中都会有出血，这是因为菌斑牙石等刺激牙龈发生炎症，炎症越严重，牙龈出血也越明显。如果平时刷牙时就出血，说明牙龈炎症已不轻了。只有完全健康的牙龈在洁治时才不会出血。因此，洗牙后要坚持认真刷牙，清除牙菌斑等刺激物，就可减少牙龈出血。
