截至2005年12月31日，秭归县辖7个镇、5个乡。共有6个居委会、186个村委会。 茅坪镇 镇政府驻周家湾，人口79511人，面积206平方千米。辖3个居委会、18个村委会:西楚、桔颂、滨湖、陈家冲、九里、杨贵店、陈家坝、建东、溪口坪、乔家坪、泗溪、花果园、月亮包、罗家、金缸城、长岭、银杏沱、松树坳、中坝子、兰陵溪、庙河。
屈原镇 镇政府驻前山坡，人口21137人，面积215平方千米。辖1个居委会、12个村委会:新滩、西陵峡、链子岩、长江、龙马溪、天龙、铺坪、漆树坪、仙女坪、屈原、北峰、凤凰溪、九岭头。 归州镇 镇政府驻陶家坡，人口29386人，面积128平方千米。
辖1个居委会、11个村委会:归州、向家湾、彭家坡、屈原庙、周家湾、香溪、向家店、万石寺、官庄坪、盐关、贾家店、白果园。 沙镇溪镇 镇政府驻大岭，人口38271人，面积188平方千米。辖15个村委会:范家坪、长春、台子湾、大浴池、乐丰、倒座铺、千将坪、双院、三星店、高潮、梅坪、马家坝、屯里荒、树坪、马家山。
两河口镇 镇政府驻太平庵，人口31795人，面积269平方千米。辖19个村委会:两河、牌楼、两面山、宋家、王家垭、太坪、土珠庙、天池垭、云盘、月明山、中心观、薛家、铺庄、二甲、堰塘坪、香龙、白庙岭、谭家河、高桥河。 郭家坝镇 镇政府驻崔家湾，人口53166人，面积313平方千米。
辖1个居委会、20个村委会:卜庄河、头道河、烟灯堡、荒口坪、白云山、郭家坝、王家岭、桐树湾、牛岭、柏杨坪、熊家岭、百日场、文化、夫子头、文家岩、西坡、庙垭、罗家坪、楚王井、擂鼓台、邓家坡。 杨林桥镇 镇政府驻杨林桥，人口28044人，面积235平方千米。
辖14个村委会:杨林桥、马回营、天鹅、响水洞、三渡河、凤凰岭、西阳坪、鼓锣坪、眉毛山、云峰、三台寺、白岩、赵家山、白鹤洞。 水田坝乡 乡政府驻土地岭，人口36284人，面积224平方千米。辖25个村委会:上坝、下坝、龙口、王家桥、董家冲、望砫、青蒿峪、辛家坪、陈家岭、大水田、草池平、稠木树、赦仓坪、朝东观、联营、马营、龙潭湾、野桑坪、郝家湾、良斗河、姜家坡、严坪、李家坡、牛田、石垭。
泄滩乡 乡政府驻杨家坪，人口15880人，面积145平方千米。辖13个村委会:陈家湾、万家、坊家山、棋盘岭、徐家山、陈家坡、桂花坪、牛口、白家河、九条岭、核桃坪、柴家湾、黄家山。 梅家河乡 乡政府驻祠堂湾，人口19589人，面积88平方千米。
辖13个村委会:鲁家湾、尤家湾、王家坡、京丈坪、下里坪、龙王山、陈家垧、肖家坪、水田垭、龟坪河、谭家岭、三掌坪、郑家岭。 磨坪乡 乡政府驻小磨坪，人口12608人，面积141平方千米。辖12个村委会:磨坪、一篮、龙潭坪、柏家坪、六家包、送甲山、雁落坪、银坪、升坪、三墩岩、杨林、天井坪。
周坪乡 乡政府驻周坪，人口25903人，面积275平方千米。辖14个村委会:周坪、九畹溪、桂垭、界垭、仙女、峡口、金凤、罗圈荒、九畹堂、砚窝台、槐树坪、中阳坪、石柱、穿心店。
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