首先，对比发现，两者不同点在于投资标的股票与额度限制。相较沪港通，深港通下的港股通增加了：市值50亿港币以上的恒生综合小型股指数成份股。同时，九州证券全球首席经济学家邓海清表示，最大的区别在于深市有中小板和创业板，深市的成长股是沪港通和港股市场的补充。
与沪港通类比，深港通的标的不局限于A/H股同时上市，而将包含深市成分股;由于深市成分股与沪市有很大区别，这将丰富香港投资者的投资范围，但中国的高估值成长股能否得到香港投资者认同有很大悬念。 其次，中信建投分析师王君、李而实表示，因上海、深证交易所上市公司股票在风格上存在天然的差异，沪港通和深港通在影响及作用机理上会有些不一样。
（1）深圳交易所股票数量占据了全部A股上市公司的60%，包括深圳主板、中小板以及创业板，与上证股票相比，深交所股票平均市值更小，交易及活跃度水平更高。 （2）从两市公司市盈率和市净率的走势能够看出，自09年之后深证股票估值水平大幅超越上证，当前深证股票平均市盈率大概是上证的两倍；再者，15年以来上证380的换手率普遍低于深证成指和中小创新指数，特别是中小创新指数在活跃度上要明显领先。
（3）通过对比沪股通和深股通标的股票的差异，显然看到深股通标的中小盘股比例显著提升，以深港通方案获批当天收盘价格计算，满足深股通北向标的股中一半以上的股票市值都集中在60-200亿。
答： 沪港通下的港股通标的范围是恒生综合大型股指数的成份股、恒生综合中型股指数的成份股，以及同时在香港联合交易所、上海证券交易所上市的A＋H股公司股票。 深港...详情>>
答：介绍上市和普通IPO都是境外较为常见的上市模式，只是国内A股市场 还没有类似的模式。两者最直接的区别在于介绍上市没有“公开招股” 一环， 所以： (1) IPO...详情>>
答：大盘破了中短线位,五连阴了,接下来 该反弹了！次新股、二线蓝筹股有机会！详情>>
