尸检见皮肤、黏膜及内脏出血,多见于心、胃肠、肺〇脑出血的发生率为52.6%。出血的主要原因是血小板减少和血管壁异常,后者可见甲皱微血管形态和功能改变。血小板质也有异常,小型血小板占
50%,外形不规则、突起少、浆透明、颗粒少;血小板吸附性、聚集性和第 3因子也明显低于正常。血中出现类肝素,蛋白C抗原含量及抗凝血酶活性增高。再生障碍性贫血患者易并发各种感染,以革兰阴性杆菌包括大肠杆菌、铜绿假单胞菌及金黄色葡萄球菌为主。细菌人侵途径除皮肤、黏膜外,胃肠道屏障功能降低或因出血及黏膜溃疡也是重要的人侵部位。机体防御功能减退和粒细胞及单核细胞减少以及淋巴组织萎缩都有密切关系,后者以SAA为著,导致不同程度的细胞及体液免疫异常。反复输血者可见含铁血黄素沉着,甚至发生铁负荷过多。本病的死亡原因主要为颅内出血、心力衰竭、肺水肿及各种严重感染。