自体造血干细胞移植的疗效：(1)急性髓性白血病。治疗效果和移植时患者所处的疾病状态有关，第一次完全缓解者的移植后3年生存率为50%左右，第二次完全缓解者为40%左右，而未获完全缓解的难治或复发者则仅为20%左右。因此，应尽量选择获得完全缓解后的病例进行自体移植，因为未完全缓解者一则体内残存的白血病细胞多，二则从其骨髓或外周血采集的造血干细胞中混有较多的白血病细胞，均会造成移植后复发。总体上自体造血干细胞移植和化疗相比，白血病复发率下降了10%-20%,4年时无病生存率较化疗提高了10%-20%。近几年经过大量病例总结，发现具有良好预后指标的急性髓性白血病，如急性早幼粒细胞白血病、伴染色体8号和21号易位的m2型及伴嗜酸粒细胞增多的m4型急性髓性白血病，这些病例经诱导分化治疗、强烈联合化疗后至少50%，甚至更多的患者已获长期无病生存，其中大部分可能已治愈。所以上述病例已不主张再行自体或异体造血干细胞移植。(2)急性淋巴细胞白血病。儿童病例单纯强化疗已获得非常好的结果，故不再考虑做造血干细胞移植。成人病例的疗效和急性髓性白血病相似，也和移植时患者所处疾病状态有关。再仔细分析后认为年龄>20岁、无HLA相合的供者、处于第一次或第二次完全缓解期者适合做自体造血干细胞移植，但尚无足够的证据表明比连续化疗更好。(3)慢性髓细胞白血病、慢性淋巴细胞白血病。由于此二种慢性白血病很难达到完全缓解，故依靠自体造血干细胞移植不能解决体内残留的白血病细胞，也不能保证自体移植物的纯洁（即不含或尽量不含白血病细胞），移植的效果并不理想。因此，国内外选用者较少。但由于伊马替尼（格列卫）治疗慢性髓细胞白血病获得前所未有的满意疗效，但是否能治愈及根治尚无定论，故已有人设想在伊马替尼治疗获完全缓解的慢性髓细胞白血病患者如进行自体造血干细胞移植，极可能获得治愈的机会。
