危害百合的病毒有百合无症病毒（LSV)、百合黄瓜花叶病毒（CMV)、郁金香碎色病毒（TBV)和百合斑驳病毒（LMoV)等。主要症状有：部分植株叶片上出现淡绿色斑驳，叶片扭曲、花叶、叶缘卷缩，叶形变小，生长不良，重病株严重矮化；有的植株叶片上不产生明显症状，整株带黄色，节间缩短，植株矮化，叶片黄化、萎缩；有的植株感染黄瓜花叶病毒，叶片上产生不规则淡绿色斑驳，然后小的淡色部分连接扩大，沿叶脉成为细长黄色条斑，稍后略有凹陷，变为淡黄褐色至赤褐色，与无症病毒复合侵染后，引起坏死斑。感染病毒的植株，轻病株能开花，但花畸形；重的植株不能开花或开出花无商品价值。
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