尽管现今高等植物的呼吸类型主要是有氧呼吸，但仍保留有无氧呼吸的能力。例如，在缺氧的情况（如水淹）下，高等植物可进行短时期的无氧呼吸，以适应不利环境。在正常不缺氧的环境中，高等植物的某些部位亦进行一些无氧呼吸，如种子萌发时，种皮未破裂之前只进行无氧呼吸；体积大的贮藏器官（如甜菜块根和马铃薯块茎）和果实（如苹果果实）的内部，也进行无氧呼吸；水稻等沼泽植物具有较强烈的无氧呼吸系统。
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