然眼结石的治疗比较简单，在眼部表面麻醉下用针头剔出即可，费用也不高，但由于眼结石往往是由眼部炎症引起的，在炎症没有完全消除的时候，只将结石剔除，治标不治本，患者稍不注意，眼结石还会复发。因此治疗眼结石的重点是治疗并预防眼睛炎症。
隐形眼镜配戴者，要注意镜片的消毒保养，定期检查眼睛，若不适合配戴隐形眼镜，绝对不要勉强尝试。野外工作及居住环境易受风沙肆虐的人，最好能配戴保护的眼镜，避免风沙直接吹入眼睛。眼结石虽然只是结膜的小病变，但却是一个“危险信号”，提醒你注意眼结膜的健康。
