男性年龄对精子的影响不仅仅局限于精子数量、形态和活动力的下降。有越来越多的证据表明男性年龄与宝宝健康有关，大龄父亲所生的宝宝有遗传缺陷和其他慢性健康问题的风险也会增加，因为大龄男性往往有更多基因突变的精子。 年轻和年长的男性都会产生损坏的或不健康的精子，但是通常细胞凋亡的过程会淘汰这些有缺陷的精子。
2003年发表的一项研究发现，上了年纪的男性的细胞凋亡效率大大降低，36～57岁男性精液中含有缺陷精子的百分比要比20～35岁男性高，这也是为什么说男性年龄对宝宝健康有影响的原因之一。 有充足的记录表明，。但在纽约进行的一项大型研究发现，在妈妈40岁以上的家庭中，有一半宝宝患唐氏综合征的风险归因于爸爸的年龄过大。
在那之后更多的研究也证实，随着男性年龄的增长，宝宝患有像唐氏综合征等先天性畸形的风险会缓慢增加。 不过，在加拿大的一项对77,514个有先天性缺陷宝宝的调查得出结论，总体来看，父母的年龄与孩子先天性缺陷之间的联系很小。 其他一些与父母年龄相关的情况包括：软骨发育不全（侏儒症的一种类型）和马凡氏症候群（心血管问题以及四肢长度异常，特别是手指和脚趾）等。
不过请记住，这些情况都是极为罕见的，即使男性年龄较大，影响宝宝的风险也非常低。 研究还发现父母年龄与宝宝的慢性疾病有关，例如儿童白血病和精神分裂症等。虽然儿童白血病还与母亲的年龄和环境因素等有着密切的关系，但是在没有家族病史的情况下，精神分裂症似乎更会出现在有大龄爸爸的孩子身上。
随着在这个领域的研究越来越多，最终我们会弄清楚这些联系到底是归结于大龄男性精子的DNA突变，还是另有其他因素在起作用。
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