一、定义不同。
(1) 车船税：以车船为特征对象，向车辆、船舶（以下简称车船）的所有人或者管理人征收的一种税。
(2) 车辆购置税：是对在境内购置规定车辆的单位和个人征收的一种税，它由车辆购置附加费演变而来。
二、征收对象不同。
（1）车船税：车船税的征收范围，是指依法应当在我国车船管理部门登记的车船（除规定减免的车船外）。
车辆，包括机动车辆和非机动车辆。机动车辆，指依靠燃油、电力等能源作为动力运行的车辆，如汽车、拖拉机、无轨电车等；非机动车辆，指依靠人力、畜力运行的车辆，如三轮车、自行车、畜力驾驶车等。
船舶，包括机动船舶和非机动船舶。机动船舶，指依靠燃料等能源作为动力运行的船舶，如客轮、货船、气垫船等；非机动船舶，指依靠人力或者其他力量运行的船舶，如木船、帆船、舢板等。
（2）车辆购置税：车辆购置税以列举的车辆作为征税对象，未列举的车辆不纳税。其征税范围包括汽车、摩托车、电车、挂车、农用运输车。
三、缴费标准不同。
（1）车船税：
1.0升(含)以下 60元至360元
1.0升以上至1.6升(含) 300元至540元
1.6升以上至2.0升(含) 360元至660元
2.0升以上至2.5升(含) 660元至1200元
2.5升以上至3.0升(含) 1200元至2400元
3.0升以上至4.0升(含) 2400元至3600元
4.0升以上 3600元至5400元
（2）车辆购置税：车辆购置税实行从价定率的办法计算应纳税额，计算公式为：应纳税额=计税价格×税率。如果消费者买的是国产私车，计税价格为支付给经销商的全部价款和价外费用，不包括增值税税款。因为机动车销售专用发票的购车价中均含增值税税款，所以在计征车辆购置税税额时，必须先将增值税剔除，即车辆购置税计税价格=发票价÷1.17，然后再按10%的税率计征车辆购置税。
四、征税时间不同。
（1）车船税:车船税是每年都需要征收的，从2007年7月1日开始需要在投保交强险时缴纳车船税。
（2）车辆购置税:车辆购置税是在购车时一次性缴纳，以后在车辆使用过程中无需在缴纳购置税，如果车辆在购置时已经缴纳过购置税则无需再缴费。
法律依据：
《车辆购置税暂行条例》第四条规定，车辆购置税实行从价定率的办法计算应纳税额。应纳税额的计算公式为：应纳税额=计税价格×税率。